More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1711 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
501 aa  1019    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  38.01 
 
 
499 aa  297  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  37.25 
 
 
505 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  40.47 
 
 
523 aa  286  5e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  37.07 
 
 
489 aa  279  1e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  36.36 
 
 
504 aa  277  3e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  37.43 
 
 
499 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  37.43 
 
 
499 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0245  amine oxidase  39.25 
 
 
491 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  36.58 
 
 
517 aa  270  5.9999999999999995e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  35.28 
 
 
510 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  34.74 
 
 
494 aa  264  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  36.23 
 
 
495 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  33.33 
 
 
505 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  32.68 
 
 
505 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  30.31 
 
 
501 aa  213  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0305  amine oxidase  34.96 
 
 
492 aa  210  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16851  phytoene dehydrogenase and related protein  31.15 
 
 
503 aa  210  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  30.51 
 
 
506 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1944  phytoene dehydrogenase related enzyme  34.05 
 
 
495 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  28.46 
 
 
501 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0386  phytoene dehydrogenase related enzyme  33.92 
 
 
500 aa  199  9e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22931  phytoene dehydrogenase  32.48 
 
 
503 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 
532 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  28.85 
 
 
501 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  30.06 
 
 
512 aa  193  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  29.86 
 
 
512 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
506 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  30.04 
 
 
516 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17571  phytoene dehydrogenase and related protein  28.24 
 
 
501 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 
500 aa  189  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  31.03 
 
 
508 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  29.73 
 
 
938 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  30.08 
 
 
520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  28.27 
 
 
520 aa  180  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1385  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 
492 aa  179  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0115639 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  28.52 
 
 
503 aa  179  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3446  phytoene dehydrogenase  27.46 
 
 
489 aa  177  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.503543  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  27.93 
 
 
520 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  30.89 
 
 
504 aa  176  6e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  29.48 
 
 
518 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  30.37 
 
 
507 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  29.67 
 
 
518 aa  174  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  26.44 
 
 
514 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  26.4 
 
 
514 aa  166  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  29.48 
 
 
522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  26 
 
 
514 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  26.01 
 
 
514 aa  164  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 
515 aa  162  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  26.81 
 
 
503 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  28.04 
 
 
503 aa  162  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  27.22 
 
 
505 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  26.52 
 
 
508 aa  152  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  27.64 
 
 
513 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2816  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 
530 aa  146  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  26.65 
 
 
645 aa  146  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 
512 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 
502 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  25.58 
 
 
509 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  24.52 
 
 
509 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 
506 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 
512 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  25.58 
 
 
509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0933  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  24.23 
 
 
474 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  26.68 
 
 
512 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  28.76 
 
 
501 aa  124  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  25.38 
 
 
509 aa  123  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  26.15 
 
 
595 aa  121  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 
497 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 
497 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  25.5 
 
 
554 aa  120  6e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  27.53 
 
 
511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 
496 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  24.61 
 
 
511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  24.2 
 
 
530 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  23.94 
 
 
504 aa  108  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  24.25 
 
 
509 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  24.85 
 
 
509 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  28.28 
 
 
510 aa  103  9e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  28.6 
 
 
708 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  24.61 
 
 
492 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  26.12 
 
 
519 aa  100  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  25.6 
 
 
507 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  25.46 
 
 
633 aa  99  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  24.39 
 
 
598 aa  98.6  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3281  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 
479 aa  97.4  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463065  normal  0.0612809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  25.65 
 
 
512 aa  97.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  28.4 
 
 
711 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  26.04 
 
 
508 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 
722 aa  93.6  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 
547 aa  93.6  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 
520 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  25.65 
 
 
507 aa  89.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  20.74 
 
 
494 aa  89.4  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  23.27 
 
 
740 aa  88.6  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2465  hypothetical protein  26.97 
 
 
427 aa  87.8  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.139636  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 
717 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  24.7 
 
 
493 aa  87.4  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.72 
 
 
522 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  24.32 
 
 
511 aa  87  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>