52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1699 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1699  flavodoxin  100 
 
 
176 aa  365  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0168  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.97 
 
 
174 aa  118  5e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1824  flavodoxin  34.32 
 
 
168 aa  106  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2492  flavodoxin-like protein  36.53 
 
 
215 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4171  flavodoxin-like protein  36.36 
 
 
216 aa  97.4  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2562  Flavodoxin-like protein  33.96 
 
 
179 aa  92  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1685  flavodoxin  32.32 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0906832  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0573  protoporphyrinogen oxidase  31.18 
 
 
167 aa  75.5  4e-13  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00307777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1632  flavodoxin-like protein  31.93 
 
 
193 aa  73.6  1e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138919  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1410  Flavodoxin-like protein  27.27 
 
 
175 aa  71.6  5e-12  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00810371 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2554  Flavodoxin-like protein  29.41 
 
 
169 aa  70.9  9e-12  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2409  protoporphyrinogen oxidase  31.36 
 
 
181 aa  69.7  2e-11  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136205  normal  0.0149961 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2314  flavodoxin-like  26.74 
 
 
170 aa  68.2  6e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403811  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3023  flavodoxin  27.49 
 
 
170 aa  64.7  6e-10  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1035  protoporphyrinogen oxidase  29.48 
 
 
188 aa  60.5  1e-08  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.395736  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4324  protoporphyrinogen oxidase  25.29 
 
 
190 aa  57.4  9e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3245  flavodoxin-like protein  26.7 
 
 
176 aa  57  2e-07  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29950  hypothetical protein  28.14 
 
 
164 aa  55.5  4e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0017  protoporphyrinogen oxidase  22.54 
 
 
176 aa  52.4  4e-06  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.229911  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4255  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.81 
 
 
197 aa  52  5e-06  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2953  protoporphyrinogen oxidase  21.97 
 
 
175 aa  51.2  8e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.410486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2375  flavodoxin  28 
 
 
173 aa  51.2  8e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.185264  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0023  protoporphyrinogen oxidase  21.64 
 
 
175 aa  50.8  9e-06  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  2.62535e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00340  flavodoxin  26.88 
 
 
164 aa  50.8  1e-05  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1487  protoporphyrinogen oxidase  23.84 
 
 
175 aa  50.1  2e-05  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.040472  hitchhiker  0.00766519 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2438  Flavodoxin-like protein  40.35 
 
 
174 aa  49.7  2e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  7.94828e-07  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2108  flavodoxin-like protein  27.49 
 
 
167 aa  48.5  4e-05  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0677138  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0198  protoporphyrinogen oxidase  22.6 
 
 
173 aa  47.8  9e-05  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0025  protoporphyrinogen oxidase  24.16 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109828  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3403  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.59 
 
 
193 aa  46.2  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.200863  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0022  protoporphyrinogen oxidase  25.14 
 
 
184 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00158221  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0266  protoporphyrinogen oxidase  25.88 
 
 
177 aa  45.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0106275  normal  0.013044 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1916  protoporphyrinogen oxidase  26.79 
 
 
177 aa  45.1  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  1.7226e-07  normal  0.191063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0287  protoporphyrinogen oxidase  26.79 
 
 
177 aa  45.1  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.32863e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3929  protoporphyrinogen oxidase  26.79 
 
 
177 aa  45.1  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  3.39774e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0025  protoporphyrinogen oxidase  23.21 
 
 
175 aa  44.7  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857411 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0027  protoporphyrinogen oxidase, putative  25.14 
 
 
184 aa  44.7  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0019  protoporphyrinogen oxidase  24.71 
 
 
181 aa  44.7  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827877  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0030  protoporphyrinogen oxidase  25.7 
 
 
184 aa  44.3  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  2.5966e-05  hitchhiker  9.9426e-07 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0024  protoporphyrinogen oxidase  25.7 
 
 
184 aa  44.3  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000372207  hitchhiker  0.000782857 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0027  protoporphyrinogen oxidase  25.57 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0026  protoporphyrinogen oxidase  22.16 
 
 
179 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.87 
 
 
158 aa  41.6  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0141  Protoporphyrinogen oxidase  24.02 
 
 
173 aa  42  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19080  flavodoxin  27.75 
 
 
159 aa  41.6  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1177  flavodoxin family protein  35.82 
 
 
167 aa  41.2  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.392318  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3897  protoporphyrinogen oxidase  23.56 
 
 
179 aa  41.2  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0092686  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0019  protoporphyrinogen oxidase  22.81 
 
 
175 aa  41.2  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0019  protoporphyrinogen oxidase  24.29 
 
 
184 aa  40.8  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.309289  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0026  Protoporphyrinogen oxidase  23.73 
 
 
183 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.81014e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0027  protoporphyrinogen oxidase  23.73 
 
 
183 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0370554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  39.29 
 
 
157 aa  40.8  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>