More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1669 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  466  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 195 aa  121  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 198 aa  101  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  41 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  41 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  30.69 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1648  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00269444  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  27.97 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  25.38 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 183 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  27.84 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  43.33 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  44.78 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 182 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  20.67 
 
 		 179 aa  52.8  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 189 aa  52  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  44.07 
 
 		 180 aa  52  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1035  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168916  normal  0.097412 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22230  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.158788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  43.14 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  39.29 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5054  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 178 aa  49.7  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 191 aa  49.7  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  26.61 
 
 		 190 aa  49.3  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 332 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  44.68 
 
 		 201 aa  48.9  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1159  regulatory protein, TetR  35.53 
 
 		 231 aa  48.5  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  39.06 
 
 		 185 aa  48.5  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>