More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1605 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 595 aa  1199    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  44.64 
 
 		 525 aa  444  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  43.1 
 
 		 528 aa  425  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  44.12 
 
 		 529 aa  419  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  38.3 
 
 		 565 aa  333  5e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  37.9 
 
 		 524 aa  332  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  33.68 
 
 		 534 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  36.31 
 
 		 535 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  36.92 
 
 		 566 aa  291  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0480  extracellular solute-binding protein family 5  36.15 
 
 		 569 aa  290  6e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105843  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0216  extracellular solute-binding protein  35.51 
 
 		 553 aa  283  6.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.923383 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19540  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  36.43 
 
 		 567 aa  283  8.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.394832  normal  0.058637 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  34.8 
 
 		 530 aa  279  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0255  extracellular solute-binding protein  36.04 
 
 		 554 aa  278  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192685  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  34.97 
 
 		 545 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  33.4 
 
 		 535 aa  270  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  35.47 
 
 		 546 aa  270  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  33.83 
 
 		 535 aa  270  7e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  33.21 
 
 		 535 aa  269  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  33.21 
 
 		 535 aa  269  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  33.21 
 
 		 535 aa  269  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  33.21 
 
 		 535 aa  269  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  33.21 
 
 		 535 aa  269  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  33.21 
 
 		 535 aa  269  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  33.21 
 
 		 535 aa  269  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  35.96 
 
 		 560 aa  268  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  33.46 
 
 		 532 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 		 532 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  34.43 
 
 		 556 aa  268  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  34.25 
 
 		 556 aa  266  5.999999999999999e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 		 535 aa  265  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  32.96 
 
 		 526 aa  263  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.96 
 
 		 526 aa  263  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  32.96 
 
 		 526 aa  263  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  32.83 
 
 		 535 aa  263  6.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  31.57 
 
 		 538 aa  263  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  34.47 
 
 		 531 aa  262  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  35.12 
 
 		 528 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  32.77 
 
 		 526 aa  262  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  32.77 
 
 		 526 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  34.64 
 
 		 541 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  34.59 
 
 		 532 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  32.64 
 
 		 535 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  32.59 
 
 		 610 aa  260  6e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0658  extracellular solute-binding protein family 5  34.5 
 
 		 577 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  32.7 
 
 		 535 aa  258  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0206  extracellular solute-binding protein family 5  34.85 
 
 		 561 aa  257  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646254  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  32.07 
 
 		 535 aa  257  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  33.71 
 
 		 532 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  32.01 
 
 		 535 aa  254  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  32.01 
 
 		 535 aa  254  3e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  32.01 
 
 		 535 aa  254  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  31.44 
 
 		 530 aa  249  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  32.07 
 
 		 542 aa  249  9e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3638  extracellular solute-binding protein family 5  32.65 
 
 		 555 aa  246  9e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339986  normal  0.415005 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 		 506 aa  245  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  31.03 
 
 		 531 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  33.08 
 
 		 532 aa  244  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  31.83 
 
 		 537 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.73 
 
 		 530 aa  243  7e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  30.89 
 
 		 531 aa  243  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  32.26 
 
 		 531 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  31.9 
 
 		 589 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4235  extracellular solute-binding protein  32.71 
 
 		 542 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  31.83 
 
 		 537 aa  240  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4558  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  32.71 
 
 		 540 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.44901  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 		 532 aa  239  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1949  extracellular solute-binding protein  33.02 
 
 		 542 aa  238  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0969647  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  30.13 
 
 		 531 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3775  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.78 
 
 		 556 aa  236  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  33.21 
 
 		 529 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  30.32 
 
 		 531 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  32.07 
 
 		 531 aa  234  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2065  extracellular solute-binding protein family 5  31.23 
 
 		 543 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 		 531 aa  233  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0973  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 532 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  31.67 
 
 		 547 aa  231  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  32.26 
 
 		 532 aa  231  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  32.12 
 
 		 533 aa  231  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  32.55 
 
 		 520 aa  229  9e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2915  extracellular solute-binding protein  31.05 
 
 		 547 aa  229  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0181  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.19 
 
 		 547 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 531 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  31.04 
 
 		 541 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  31.93 
 
 		 533 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2671  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 		 542 aa  226  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.699901  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0390  extracellular solute-binding protein family 5  31.69 
 
 		 531 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18086  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0422  extracellular solute-binding protein family 5  31.5 
 
 		 531 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00166095  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4294  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 		 530 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.502669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  33.67 
 
 		 528 aa  224  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0845  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 		 532 aa  224  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.3 
 
 		 541 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 541 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  30.12 
 
 		 523 aa  223  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  32.81 
 
 		 509 aa  223  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 		 541 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3754  extracellular solute-binding protein family 5  31.13 
 
 		 542 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.884226 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3963  hypothetical protein  33.33 
 
 		 508 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.81037  normal  0.136891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2580  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 		 541 aa  216  7e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  30.75 
 
 		 541 aa  216  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.76691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>