19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1549 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1549  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  485  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  6.40295e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0063  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  30.95 
 
 
159 aa  56.6  4e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.436738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4398  hypothetical protein  34.65 
 
 
129 aa  52.8  5e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0741  hypothetical protein  34.65 
 
 
129 aa  52.8  6e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386527  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3286  hypothetical protein  26.4 
 
 
260 aa  49.7  4e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.5278 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4881  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  25.74 
 
 
261 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1854  hypothetical protein  45.28 
 
 
293 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5007  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  25 
 
 
261 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.508327  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5147  polyhydroxyalkanoate granule-associated protein PhaF  29.71 
 
 
257 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0457  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  25.41 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868468  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1550  hypothetical protein  31.68 
 
 
131 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00170451  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5057  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  24.19 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3460  hypothetical protein  40.38 
 
 
319 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0231952  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0391  Poly granule associated  29.37 
 
 
230 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2543  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  32 
 
 
163 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00882865  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66880  hypothetical protein  30.84 
 
 
138 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0559  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  27.73 
 
 
168 aa  42.4  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5800  hypothetical protein  30.84 
 
 
138 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01151  hypothetical protein  28.57 
 
 
119 aa  42  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>