More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1473 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1473  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1380 aa  2848    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 
1352 aa  333  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  43.75 
 
 
556 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  46.15 
 
 
548 aa  248  8e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.67 
 
 
1274 aa  245  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 
934 aa  234  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 
1267 aa  225  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 
1043 aa  224  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.39 
 
 
1977 aa  223  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.32 
 
 
1287 aa  221  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.14 
 
 
1363 aa  217  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  33.62 
 
 
576 aa  215  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  46.92 
 
 
573 aa  213  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  32.1 
 
 
925 aa  211  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
633 aa  211  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  27.78 
 
 
1765 aa  210  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  32.32 
 
 
905 aa  209  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  32.22 
 
 
925 aa  210  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  28.28 
 
 
1763 aa  209  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 
917 aa  208  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
1045 aa  208  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 
936 aa  208  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 
922 aa  207  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.34 
 
 
1767 aa  206  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 
917 aa  204  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.87 
 
 
1767 aa  204  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 
791 aa  204  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.87 
 
 
1767 aa  204  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 
919 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0931  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 
446 aa  202  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.523505  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.62 
 
 
1771 aa  202  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  44.36 
 
 
1046 aa  202  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 
917 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.73 
 
 
929 aa  201  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
763 aa  199  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.59 
 
 
937 aa  199  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1586  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.9 
 
 
442 aa  198  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1611  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.9 
 
 
442 aa  198  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1369  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 
767 aa  197  8.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0713189  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 
1361 aa  197  8.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
646 aa  197  9e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.83 
 
 
933 aa  197  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 
916 aa  197  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  36.55 
 
 
603 aa  197  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  32.25 
 
 
778 aa  197  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  30.17 
 
 
1042 aa  197  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.84 
 
 
952 aa  197  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 
568 aa  197  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  31.95 
 
 
1135 aa  197  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.52 
 
 
1068 aa  197  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 
945 aa  196  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  30.65 
 
 
923 aa  196  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.73 
 
 
1784 aa  197  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 
778 aa  196  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  30.53 
 
 
942 aa  196  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.95 
 
 
1040 aa  197  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.39 
 
 
1362 aa  196  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.4 
 
 
1255 aa  196  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.1 
 
 
1245 aa  196  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
911 aa  196  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 
1236 aa  196  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2901  GAF sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 
733 aa  195  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.248575  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.76 
 
 
1142 aa  195  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  28.78 
 
 
1014 aa  195  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  41.25 
 
 
576 aa  195  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4197  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
679 aa  195  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
832 aa  195  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 
1236 aa  194  7e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 
1236 aa  194  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
600 aa  194  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  28.6 
 
 
1200 aa  194  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  29.33 
 
 
1361 aa  194  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5073  CBS sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 
1118 aa  194  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.749087  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  32.77 
 
 
918 aa  194  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.16 
 
 
1166 aa  194  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.64 
 
 
1768 aa  193  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 
752 aa  193  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  27.6 
 
 
1236 aa  193  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  41.44 
 
 
729 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1561  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 
443 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 
456 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 
775 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 
1313 aa  192  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.28 
 
 
1782 aa  192  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  31.9 
 
 
858 aa  191  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 
371 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
523 aa  191  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 
1333 aa  191  8e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 
1230 aa  191  9e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.37 
 
 
1792 aa  191  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  30.52 
 
 
910 aa  191  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  34.72 
 
 
823 aa  190  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
775 aa  191  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 
1765 aa  190  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 
1202 aa  191  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.67 
 
 
932 aa  189  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
782 aa  189  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.97 
 
 
927 aa  189  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 
823 aa  190  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
827 aa  189  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>