More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1422 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
250 aa  506  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  49.38 
 
 
250 aa  229  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  48.36 
 
 
249 aa  225  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  48.75 
 
 
269 aa  221  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2331  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.78 
 
 
151 aa  91.3  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  43.56 
 
 
142 aa  86.7  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  32.81 
 
 
570 aa  86.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5013  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.03 
 
 
141 aa  85.9  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  38.78 
 
 
108 aa  84.7  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1929  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.9 
 
 
139 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0887571  normal  0.148865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  29.84 
 
 
563 aa  84.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  41 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2469  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.35 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  41.05 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
139 aa  79  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.19 
 
 
141 aa  79  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0750  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.66 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.194451  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  38.83 
 
 
111 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  32.41 
 
 
110 aa  75.5  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  37 
 
 
118 aa  74.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5092  anti-sigma-factor antagonist  43 
 
 
108 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511097  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1160  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.16 
 
 
138 aa  72  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.620968  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1666  sensor histidine kinase  34.13 
 
 
142 aa  71.6  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  37.74 
 
 
116 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  35.14 
 
 
120 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  32.04 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  37.74 
 
 
116 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  38.78 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  36.79 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4032  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.65 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  36.27 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  35.14 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 
110 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.41 
 
 
110 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.19 
 
 
113 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0837  RsbW protein, putative  32.77 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2418  anti-sigma-factor antagonist  34.58 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.217831  normal  0.711574 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  40.34 
 
 
115 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  37.76 
 
 
111 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5017  anti-sigma-factor antagonist  36.89 
 
 
119 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  36.28 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  31.19 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1794  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.83 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2527  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.94 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  33.71 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2409  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  36.08 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  29.59 
 
 
116 aa  64.7  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  37.74 
 
 
116 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  35.05 
 
 
112 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  35.05 
 
 
112 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0063  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  32.46 
 
 
140 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0713993 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2057  anti-anti-sigma factor  37.84 
 
 
117 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  30.89 
 
 
160 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  30.89 
 
 
160 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  30.89 
 
 
160 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  30.89 
 
 
160 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  27 
 
 
110 aa  63.9  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 
111 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  30.89 
 
 
160 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  30.89 
 
 
160 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  30.89 
 
 
160 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
116 aa  63.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  43.43 
 
 
107 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.84 
 
 
146 aa  63.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.459983  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  30.89 
 
 
160 aa  62.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  35.35 
 
 
436 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  37.74 
 
 
115 aa  62.4  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1040  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  30.33 
 
 
143 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.469899  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  40.21 
 
 
111 aa  62.8  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  30.89 
 
 
160 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0863  putative anti-sigma regulatory factor  30.33 
 
 
143 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.286315 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  30.89 
 
 
160 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 
108 aa  62  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  29.36 
 
 
120 aa  62  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2529  anti-sigma-factor antagonist  37.93 
 
 
100 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  35.56 
 
 
122 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.03 
 
 
143 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  32.46 
 
 
116 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2441  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 
138 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  31.13 
 
 
116 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  37.36 
 
 
111 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  34.38 
 
 
112 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1997  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 
495 aa  61.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 
117 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  32.46 
 
 
116 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0933  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.44 
 
 
142 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0815302  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  30 
 
 
117 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 
115 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  28.72 
 
 
112 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  32.74 
 
 
116 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  32.74 
 
 
116 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  32.74 
 
 
116 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  32.74 
 
 
116 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  32.74 
 
 
116 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  32.74 
 
 
116 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  32.74 
 
 
116 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 
170 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>