140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1393 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1393  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 384 aa  769    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.632841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3124  anti-sigma-factor antagonist  41.3 
 
 		 379 aa  258  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0052  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2210  anti-sigma-factor antagonist  34.06 
 
 		 580 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  29.88 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4698  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4192  anti-sigma-factor antagonist  28.79 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4422  putative PAS/PAC sensor protein  31.58 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1037  putative PAS/PAC sensor protein  35.54 
 
 		 484 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  29.44 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1708  putative PAS/PAC sensor protein  31.65 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  29.89 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  31.88 
 
 		 568 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  31.93 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1894  anti-sigma-factor antagonist  31.41 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  25.73 
 
 		 689 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  28.73 
 
 		 521 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  25.6 
 
 		 361 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0409  putative PAS/PAC sensor protein  33.88 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 559 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  28.99 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  31.21 
 
 		 385 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  26.97 
 
 		 365 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3473  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 422 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.551903  normal  0.0822697 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  27.64 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  25.77 
 
 		 365 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4490  anti-sigma-factor antagonist  29.08 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  decreased coverage  0.000741245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  31.47 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  26.82 
 
 		 523 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  27.5 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  32.74 
 
 		 638 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  28.04 
 
 		 653 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  34.58 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000586353  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0621  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0312248 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0268  anti-sigma-factor antagonist  31.72 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0598617 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0868  anti-sigma-factor antagonist  28.68 
 
 		 506 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  31.85 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  31.09 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 556 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  30.32 
 
 		 562 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  30.4 
 
 		 653 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  28.68 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3476  anti-sigma-factor antagonist  30.14 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.837777  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1485  anti-sigma-factor antagonist  27.64 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  31.67 
 
 		 667 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4191  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  31.16 
 
 		 509 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3649  anti-sigma-factor antagonist  24.88 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  25.48 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  28.5 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2646  anti-sigma-factor antagonist  30.05 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0413  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4153  anti-sigma-factor antagonist  28.96 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.893474  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  36.11 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0577  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  28.08 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  28.68 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  29.46 
 
 		 315 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3508  anti-sigma-factor antagonist  27.45 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  28.99 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  28.17 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3857  anti-sigma-factor antagonist  27.66 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3442  anti-sigma-factor antagonist  27.23 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3609  anti-sigma-factor antagonist  29.14 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.196503  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0195  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1074  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2503  anti-sigma-factor antagonist  29.92 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244324 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  30.7 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  30.83 
 
 		 325 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3744  anti-sigma-factor antagonist  28.79 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  31.53 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2206  anti-sigma-factor antagonist  29.09 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0474  anti-sigma-factor antagonist  27.97 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  28.32 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  26.95 
 
 		 549 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2689  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 		 314 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  32.04 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2740  anti-sigma-factor antagonist  27.88 
 
 		 307 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  27.83 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0092  anti-sigma-factor antagonist  27.17 
 
 		 317 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.463616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  32.97 
 
 		 283 aa  54.3  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  32.41 
 
 		 271 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 281 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  27.43 
 
 		 299 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.33 
 
 		 272 aa  53.5  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1835  anti-sigma-factor antagonist  25.71 
 
 		 331 aa  53.5  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  28.07 
 
 		 388 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3688  anti-sigma-factor antagonist  30.82 
 
 		 350 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109455  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2986  anti-sigma-factor antagonist  26.56 
 
 		 341 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1239  anti-sigma-factor antagonist  36 
 
 		 314 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.974707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  29.46 
 
 		 655 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 		 291 aa  52.8  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  29.77 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1098  anti-sigma-factor antagonist  27.21 
 
 		 514 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  28.77 
 
 		 694 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  28.26 
 
 		 653 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>