More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1307 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 231 aa  464  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  65.8 
 
 		 233 aa  290  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0767  DNA repair protein RadC  64.35 
 
 		 233 aa  288  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  63.8 
 
 		 229 aa  287  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  56.44 
 
 		 234 aa  261  6e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  53.15 
 
 		 227 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  44.93 
 
 		 233 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  46.15 
 
 		 236 aa  211  9e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  45.25 
 
 		 230 aa  204  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  51.1 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  52.02 
 
 		 229 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  41.33 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  44.29 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  42.99 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  43.84 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  40.91 
 
 		 229 aa  185  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  40.44 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  42.47 
 
 		 225 aa  184  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  42.01 
 
 		 225 aa  184  9e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  41.18 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  42.08 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  42.19 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  43.81 
 
 		 233 aa  181  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 241 aa  181  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  42.01 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  42.01 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  42.01 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  42.01 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  42.01 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  41.55 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  43.64 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  41.1 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  41.04 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  40.44 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  41.59 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  39.3 
 
 		 245 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  41.43 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  41.18 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  39.01 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5000  DNA repair protein RadC  49.71 
 
 		 204 aa  168  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982457  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  38.64 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2972  DNA repair protein RadC  42.04 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0056  DNA repair protein RadC  38.07 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183755  normal  0.0623388 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  37.32 
 
 		 222 aa  165  6.9999999999999995e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0061  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 222 aa  164  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000803057  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0055  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 222 aa  164  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00110117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4155  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 222 aa  164  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000385869  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  38.74 
 
 		 222 aa  164  9e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  43.94 
 
 		 206 aa  164  9e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  34.93 
 
 		 232 aa  162  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  39.82 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0358  DNA repair protein RadC  39.82 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0732931  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0528  DNA repair protein RadC  39.82 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  40.27 
 
 		 224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  41.67 
 
 		 230 aa  161  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  39.73 
 
 		 224 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  37.67 
 
 		 228 aa  161  9e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  40.36 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  39.01 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1917  DNA repair protein RadC  37.84 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  41.01 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  40.48 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  39.38 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  40.36 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  36.74 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  39.82 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  36.74 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  38.56 
 
 		 243 aa  155  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  40.27 
 
 		 223 aa  155  7e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  37.39 
 
 		 229 aa  155  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  36.74 
 
 		 222 aa  154  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  36.4 
 
 		 225 aa  154  8e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  36.74 
 
 		 222 aa  154  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  36.74 
 
 		 222 aa  154  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  36.74 
 
 		 222 aa  154  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  36.74 
 
 		 222 aa  154  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000017896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  36.74 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  38.14 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  38.12 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  38.14 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  38.14 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  38.14 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  38.14 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  38.14 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  39.01 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4842  DNA repair protein RadC  38.18 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000109613  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4100  DNA repair protein RadC  37.67 
 
 		 221 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0607652  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 224 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  38.39 
 
 		 228 aa  151  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4063  DNA repair protein RadC  36.74 
 
 		 222 aa  151  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000737579  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  38.5 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0101  DNA repair protein RadC  38.25 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000716823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0144  DNA repair protein RadC  34.7 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00783617  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  36.44 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>