More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1303 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  100 
 
 
669 aa  1371    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  41.97 
 
 
554 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  41.16 
 
 
555 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  39.28 
 
 
560 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  39.28 
 
 
560 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  39.28 
 
 
560 aa  361  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  39.28 
 
 
560 aa  361  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  39.28 
 
 
560 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  39.28 
 
 
560 aa  361  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  39.08 
 
 
560 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  38.88 
 
 
560 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  39.08 
 
 
560 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  39.08 
 
 
560 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  38.92 
 
 
560 aa  355  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  36.83 
 
 
584 aa  338  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  37.69 
 
 
572 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  39.69 
 
 
578 aa  334  3e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  37.02 
 
 
584 aa  334  4e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  36.44 
 
 
467 aa  303  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  29.34 
 
 
988 aa  224  4e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  29.83 
 
 
921 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  30.42 
 
 
915 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  29.75 
 
 
915 aa  207  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  29.87 
 
 
916 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  25.24 
 
 
971 aa  197  6e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  28.49 
 
 
805 aa  194  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  28.96 
 
 
877 aa  193  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  31.04 
 
 
541 aa  193  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  28.89 
 
 
951 aa  192  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  28.89 
 
 
801 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.77 
 
 
961 aa  188  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  27.19 
 
 
1129 aa  188  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  28.34 
 
 
933 aa  188  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  29.48 
 
 
972 aa  187  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  28.84 
 
 
963 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  28.07 
 
 
941 aa  184  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  28.07 
 
 
941 aa  184  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 
1002 aa  183  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  28.19 
 
 
966 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  25.44 
 
 
969 aa  181  4e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  28.37 
 
 
947 aa  177  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  27.43 
 
 
969 aa  177  8e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  27.34 
 
 
955 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  28.05 
 
 
665 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  26.63 
 
 
1138 aa  176  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  27.43 
 
 
1165 aa  171  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  27.46 
 
 
894 aa  171  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  26.36 
 
 
1284 aa  169  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  27.48 
 
 
942 aa  168  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  25.34 
 
 
937 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  28.66 
 
 
872 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  27.39 
 
 
1057 aa  165  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  26.38 
 
 
1046 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  27.12 
 
 
967 aa  163  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  28.07 
 
 
663 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  28.24 
 
 
1043 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  26.17 
 
 
1116 aa  161  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  26.89 
 
 
966 aa  162  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  26.83 
 
 
777 aa  161  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.26 
 
 
960 aa  160  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  28.31 
 
 
900 aa  160  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  28.33 
 
 
773 aa  160  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  26.35 
 
 
1045 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  30.08 
 
 
1025 aa  159  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  27.07 
 
 
1167 aa  159  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  26.59 
 
 
1147 aa  158  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  27.21 
 
 
1145 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.95 
 
 
1112 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  28.6 
 
 
903 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  27.24 
 
 
1167 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  27.3 
 
 
1167 aa  157  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  25.36 
 
 
1168 aa  157  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  26.99 
 
 
1032 aa  157  8e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  27.18 
 
 
896 aa  156  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  26.53 
 
 
1031 aa  156  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  27.62 
 
 
1031 aa  156  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  26.6 
 
 
918 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  26.41 
 
 
914 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  26.67 
 
 
835 aa  155  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  27.02 
 
 
1046 aa  154  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  24.84 
 
 
1038 aa  154  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  26.51 
 
 
1144 aa  154  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  25.84 
 
 
964 aa  154  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0352  ATP-dependent helicase HepA  27.16 
 
 
969 aa  153  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  27.96 
 
 
1449 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  28.12 
 
 
1134 aa  151  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  25.59 
 
 
876 aa  151  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  26.77 
 
 
1386 aa  150  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  27.31 
 
 
919 aa  150  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  26.46 
 
 
1170 aa  150  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4753  non-specific serine/threonine protein kinase  26.24 
 
 
633 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.830487  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  28.25 
 
 
1181 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  27.49 
 
 
970 aa  149  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  26.71 
 
 
621 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  27.58 
 
 
1178 aa  148  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  27.87 
 
 
988 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002392  RNA polymerase associated protein RapA  27.87 
 
 
969 aa  147  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000609656  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  25.58 
 
 
1362 aa  147  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  26.91 
 
 
1159 aa  146  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  27.65 
 
 
1084 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>