165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1180 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 485 aa  991    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  47.44 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  43.84 
 
 		 450 aa  346  4e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  42.89 
 
 		 449 aa  341  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  43.53 
 
 		 447 aa  339  7e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  42.79 
 
 		 448 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  43 
 
 		 544 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  42.82 
 
 		 452 aa  332  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  44.2 
 
 		 450 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  44.2 
 
 		 450 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  41.83 
 
 		 452 aa  330  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  41.23 
 
 		 451 aa  327  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  44.52 
 
 		 440 aa  327  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  44.44 
 
 		 451 aa  327  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  43.52 
 
 		 452 aa  323  3e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  39.75 
 
 		 424 aa  323  6e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  41.97 
 
 		 453 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  42.48 
 
 		 449 aa  318  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  41.49 
 
 		 453 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  42.04 
 
 		 448 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  41.87 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  39.23 
 
 		 452 aa  306  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  43.13 
 
 		 464 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  40.81 
 
 		 462 aa  288  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  38.78 
 
 		 464 aa  286  5.999999999999999e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  40.4 
 
 		 448 aa  286  8e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  38.88 
 
 		 498 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  38.54 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  38.33 
 
 		 482 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  38.77 
 
 		 448 aa  274  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  37.44 
 
 		 444 aa  243  7e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  37.66 
 
 		 455 aa  241  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  34.33 
 
 		 466 aa  232  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  34 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  34.8 
 
 		 447 aa  213  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  32.75 
 
 		 442 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  30.87 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 		 495 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  22.72 
 
 		 452 aa  69.7  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  36.61 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  35.51 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.03 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  21.74 
 
 		 434 aa  63.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  23.21 
 
 		 423 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  22.77 
 
 		 424 aa  63.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  21.96 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0637  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.4 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  20.81 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  21.14 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.37 
 
 		 458 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.44 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  27.33 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  35.07 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 427 aa  57  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 441 aa  57  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  21.66 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 415 aa  55.1  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  22.38 
 
 		 419 aa  54.7  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  20.28 
 
 		 435 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 414 aa  54.3  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 443 aa  53.9  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  22.74 
 
 		 448 aa  53.9  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 460 aa  53.9  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6972  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  22.96 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 		 440 aa  53.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1515  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 425 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6314  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 425 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.619662 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>