More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0872 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 292 aa  598  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0874  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 296 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 265 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 255 aa  118  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  34.58 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  32.77 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  34.84 
 
 		 297 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  37.93 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12670  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  34.85 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6385  transcriptional regulator, AraC family  35.34 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2057  helix-turn-helix domain-containing protein  31.85 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2175  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 281 aa  95.5  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0644092  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2180  helix-turn-helix domain-containing protein  35.68 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.971115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0610  helix-turn-helix domain-containing protein  35.86 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  40.16 
 
 		 148 aa  84  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  41.84 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  42.71 
 
 		 164 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  49.37 
 
 		 151 aa  80.9  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 147 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  39.64 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  41.84 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  39.64 
 
 		 168 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  42.55 
 
 		 145 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  49.37 
 
 		 144 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  44.21 
 
 		 156 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  45.65 
 
 		 145 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  46.84 
 
 		 149 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 148 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  41.56 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  46.84 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  46.84 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  38.97 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  37.86 
 
 		 158 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 156 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 176 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 204 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3526  transcriptional regulator, AraC family  24.12 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0204519  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  45.57 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  45.78 
 
 		 148 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  43.68 
 
 		 147 aa  73.9  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 517 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  45.68 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  37.21 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2380  transcriptional regulator, AraC family  43.18 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0838291  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4687  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3237  transcriptional regulator, AraC family  34.11 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.434177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  44.19 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  41.49 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  44.58 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  36.8 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  35 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  44.3 
 
 		 147 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3232  transcriptional regulator, AraC family  33.55 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0599312  hitchhiker  0.0000105754 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  31.48 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2436  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 150 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  44.3 
 
 		 160 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9084  transcriptional regulator AraC family  34.78 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 157 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 150 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1434  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 150 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>