More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0810 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  60 
 
 		 681 aa  800    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  56.57 
 
 		 726 aa  734    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  50.74 
 
 		 712 aa  646    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  57.58 
 
 		 718 aa  749    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 673 aa  1373    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  49.03 
 
 		 672 aa  625  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  48.13 
 
 		 671 aa  616  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  47.77 
 
 		 670 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  47.75 
 
 		 668 aa  611  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.3 
 
 		 676 aa  611  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.66 
 
 		 670 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  47.83 
 
 		 670 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  47.59 
 
 		 668 aa  610  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.64 
 
 		 670 aa  608  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  47.97 
 
 		 683 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  48.87 
 
 		 666 aa  603  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  47.02 
 
 		 674 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  45.52 
 
 		 663 aa  599  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  47.02 
 
 		 674 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  47.96 
 
 		 673 aa  596  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.63 
 
 		 669 aa  592  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  48.57 
 
 		 672 aa  594  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  47.5 
 
 		 691 aa  594  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  47.85 
 
 		 675 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.48 
 
 		 669 aa  590  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.48 
 
 		 669 aa  590  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.48 
 
 		 669 aa  590  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.63 
 
 		 669 aa  589  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.27 
 
 		 679 aa  590  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  47.2 
 
 		 670 aa  590  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  47.6 
 
 		 684 aa  591  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  46.63 
 
 		 678 aa  591  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  47.31 
 
 		 685 aa  588  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  48.26 
 
 		 659 aa  590  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.48 
 
 		 669 aa  590  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.48 
 
 		 669 aa  588  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.33 
 
 		 669 aa  588  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  45.79 
 
 		 711 aa  585  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.48 
 
 		 669 aa  588  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.18 
 
 		 669 aa  587  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  47.41 
 
 		 661 aa  587  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.33 
 
 		 669 aa  587  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  44.88 
 
 		 662 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  48.11 
 
 		 671 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.07 
 
 		 670 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  46.01 
 
 		 677 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  45.2 
 
 		 688 aa  579  1e-164  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  45.2 
 
 		 688 aa  579  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  45.55 
 
 		 690 aa  581  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  47.53 
 
 		 672 aa  576  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  45.39 
 
 		 667 aa  578  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  46.22 
 
 		 689 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  45.56 
 
 		 683 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  46.37 
 
 		 669 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.78 
 
 		 680 aa  577  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0647  DNA ligase, NAD-dependent  46.68 
 
 		 707 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  45.39 
 
 		 667 aa  578  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  45.91 
 
 		 673 aa  578  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  45.93 
 
 		 690 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  46.46 
 
 		 673 aa  578  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  46.22 
 
 		 691 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0571  DNA ligase, NAD-dependent  46.27 
 
 		 680 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135698  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  44.65 
 
 		 672 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1516  DNA ligase (NAD(+))  46 
 
 		 681 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000678531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  45.78 
 
 		 690 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  45.51 
 
 		 673 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.31 
 
 		 738 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  44.34 
 
 		 663 aa  571  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.93 
 
 		 670 aa  571  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  45.87 
 
 		 691 aa  571  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  42.9 
 
 		 681 aa  571  1e-161  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  45.32 
 
 		 674 aa  569  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  45.01 
 
 		 721 aa  569  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  45.14 
 
 		 694 aa  569  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.55 
 
 		 671 aa  566  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  45.55 
 
 		 671 aa  566  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0596  DNA ligase, NAD-dependent  45.98 
 
 		 677 aa  567  1e-160  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  44.75 
 
 		 665 aa  566  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.63 
 
 		 670 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  45.52 
 
 		 685 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  46.7 
 
 		 683 aa  568  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.55 
 
 		 671 aa  566  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.93 
 
 		 680 aa  568  1e-160  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.63 
 
 		 670 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  45.52 
 
 		 685 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_536  DNA ligase, NAD-dependent  46.13 
 
 		 680 aa  568  1e-160  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.77 
 
 		 671 aa  568  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  45.55 
 
 		 671 aa  566  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1816  DNA ligase, NAD-dependent  45.45 
 
 		 707 aa  568  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.633094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.55 
 
 		 671 aa  566  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0801  DNA ligase, NAD-dependent  45.49 
 
 		 678 aa  566  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.62 
 
 		 671 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  44.85 
 
 		 691 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1705  DNA ligase, NAD-dependent  45.37 
 
 		 685 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000114947  decreased coverage  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  44.96 
 
 		 690 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  45.32 
 
 		 685 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  44.56 
 
 		 746 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  44.56 
 
 		 691 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.4 
 
 		 671 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  44.56 
 
 		 691 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>