238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0808 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0683  Phosphoenolpyruvate carboxylase  51.63 
 
 
922 aa  907    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.781097  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2967  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.31 
 
 
910 aa  927    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000103268 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0577  Phosphoenolpyruvate carboxylase  50.93 
 
 
922 aa  920    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.222337 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1629  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.12 
 
 
923 aa  881    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3110  phosphoenolpyruvate carboxylase  54.24 
 
 
908 aa  914    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.150886 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2855  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.91 
 
 
922 aa  842    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0808  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 
908 aa  1832    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0209  Phosphoenolpyruvate carboxylase  53.3 
 
 
912 aa  891    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00083066 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2974  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.03 
 
 
914 aa  863    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0559  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.03 
 
 
922 aa  918    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0606  Phosphoenolpyruvate carboxylase  52.34 
 
 
922 aa  915    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0058  Phosphoenolpyruvate carboxylase  54.73 
 
 
910 aa  897    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.424552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0226  phosphoenolpyruvate carboxylase  54.02 
 
 
911 aa  904    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.695017  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1718  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.09 
 
 
919 aa  488  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.333688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3664  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.74 
 
 
916 aa  488  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0387741  normal  0.313845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1753  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.12 
 
 
922 aa  478  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0935488  normal  0.649239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7118  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.47 
 
 
920 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700949  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2137  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37 
 
 
922 aa  476  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.24789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1801  phosphoenolpyruvate carboxylase  37 
 
 
922 aa  476  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.369049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3255  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.29 
 
 
920 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5925  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.28 
 
 
946 aa  458  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613814  normal  0.197386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6558  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.97 
 
 
920 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.985726  normal  0.0731651 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.24 
 
 
939 aa  423  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.67 
 
 
929 aa  426  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.67 
 
 
929 aa  426  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.79 
 
 
906 aa  421  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.56 
 
 
928 aa  413  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.04 
 
 
947 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.32 
 
 
929 aa  412  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.05 
 
 
928 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.89 
 
 
946 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.89 
 
 
946 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.89 
 
 
946 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.58 
 
 
938 aa  405  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.48 
 
 
929 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.64 
 
 
936 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.13 
 
 
920 aa  395  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.56 
 
 
945 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.47 
 
 
918 aa  392  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.31 
 
 
929 aa  388  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.91 
 
 
933 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0841  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.48 
 
 
939 aa  389  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.06 
 
 
957 aa  385  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.56 
 
 
933 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.46 
 
 
950 aa  385  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.85 
 
 
949 aa  382  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.22 
 
 
923 aa  382  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0178  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.94 
 
 
940 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.52 
 
 
1001 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.14 
 
 
954 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.1 
 
 
929 aa  376  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.97 
 
 
985 aa  379  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04694  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.26 
 
 
896 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.510612  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.86 
 
 
947 aa  378  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.33 
 
 
982 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.18 
 
 
930 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.37 
 
 
1002 aa  379  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.72 
 
 
937 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0729  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.7 
 
 
994 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.26 
 
 
926 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1228  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.7 
 
 
1085 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.774396  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2536  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.67 
 
 
921 aa  373  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366441  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.91 
 
 
933 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.71 
 
 
946 aa  376  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.76 
 
 
936 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.18 
 
 
951 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.7 
 
 
994 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.7 
 
 
994 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.7 
 
 
994 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.7 
 
 
1024 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.7 
 
 
994 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.15 
 
 
1075 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.74 
 
 
1006 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.37 
 
 
1088 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.26 
 
 
994 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.81 
 
 
1009 aa  372  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.59 
 
 
898 aa  370  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.45 
 
 
937 aa  373  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.07 
 
 
949 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.2 
 
 
934 aa  373  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.11 
 
 
931 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.96 
 
 
970 aa  368  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0828  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.71 
 
 
928 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.891362  normal  0.27066 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.96 
 
 
949 aa  369  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.8 
 
 
972 aa  369  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.56 
 
 
1023 aa  365  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.44 
 
 
998 aa  366  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.37 
 
 
1030 aa  365  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.44 
 
 
998 aa  364  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.21 
 
 
937 aa  364  4e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.14 
 
 
896 aa  363  8e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.18 
 
 
1008 aa  363  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.55 
 
 
1009 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.52 
 
 
932 aa  362  1e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.55 
 
 
994 aa  362  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.55 
 
 
1009 aa  362  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1653  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.06 
 
 
892 aa  360  8e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0256628  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1822  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.52 
 
 
926 aa  360  9e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.389962  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.25 
 
 
952 aa  360  9e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2252  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.07 
 
 
1017 aa  359  9.999999999999999e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0123033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>