138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0790 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0790  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  693    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2905  hypothetical protein  25.29 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000828177  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  29.21 
 
 		 717 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  35.04 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  35.29 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  27.62 
 
 		 1113 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.46 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.21 
 
 		 422 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  34.21 
 
 		 422 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  34.45 
 
 		 474 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3242  Fibronectin type III domain protein  37.89 
 
 		 405 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.643664  normal  0.636807 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  27.23 
 
 		 1111 aa  53.5  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  27.78 
 
 		 298 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  27.81 
 
 		 618 aa  53.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  29.91 
 
 		 439 aa  52.8  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.58 
 
 		 695 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.232589 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  24.71 
 
 		 629 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  27.36 
 
 		 434 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  26.76 
 
 		 434 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  32.03 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  33.08 
 
 		 415 aa  50.8  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.29 
 
 		 292 aa  50.4  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  26.45 
 
 		 450 aa  50.4  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  34.17 
 
 		 430 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  25.96 
 
 		 443 aa  50.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  27.89 
 
 		 567 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  33.06 
 
 		 432 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  33.06 
 
 		 432 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  26.67 
 
 		 1062 aa  49.7  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  27.43 
 
 		 442 aa  49.3  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30 
 
 		 677 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  27 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  27 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  30.36 
 
 		 1060 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  28.85 
 
 		 437 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  28.48 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  30.65 
 
 		 432 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  30.51 
 
 		 440 aa  48.5  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  30.51 
 
 		 437 aa  48.5  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  31.2 
 
 		 430 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  28.75 
 
 		 451 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2755  WD40 domain-containing protein  44.83 
 
 		 160 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  27.54 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  31.36 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  27 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.69 
 
 		 1028 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  27.64 
 
 		 442 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3347  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  44.83 
 
 		 160 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52168  normal  0.409524 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0588  WD40 domain protein beta Propeller  32.38 
 
 		 439 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000301748  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  32.58 
 
 		 430 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  32.58 
 
 		 430 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  25.85 
 
 		 1138 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  29.46 
 
 		 1067 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  24.56 
 
 		 446 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  30.17 
 
 		 1079 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  28.22 
 
 		 403 aa  47  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  31.93 
 
 		 672 aa  47  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  27.66 
 
 		 421 aa  46.6  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  26.63 
 
 		 442 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  26.63 
 
 		 442 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  26.63 
 
 		 442 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  27.23 
 
 		 1078 aa  46.6  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 451 aa  46.6  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  26.63 
 
 		 442 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  28.18 
 
 		 1065 aa  46.2  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.37 
 
 		 430 aa  46.2  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1094  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.7 
 
 		 680 aa  46.2  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.764126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  27.2 
 
 		 1097 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  26.77 
 
 		 656 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  30.65 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  26.67 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  27.09 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2260  WD40 domain-containing protein  26.18 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  30 
 
 		 440 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  25.58 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  31.06 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  24.84 
 
 		 969 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  31.11 
 
 		 1059 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1021 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  30.3 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  30.3 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  26.38 
 
 		 1062 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  27.18 
 
 		 436 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  28.18 
 
 		 1081 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0311  WD40 domain protein beta Propeller  32.12 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  30.3 
 
 		 431 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  40 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  26.29 
 
 		 420 aa  44.3  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  26.26 
 
 		 656 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  26.57 
 
 		 450 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.33 
 
 		 678 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2014  hypothetical protein  31.93 
 
 		 197 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.598603 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.11 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1039  WD40 domain-containing protein  27.42 
 
 		 379 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  30.95 
 
 		 431 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  30.95 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  30.95 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  29.03 
 
 		 423 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  25.89 
 
 		 572 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  29.03 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>