266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0767 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0767  ribosomal protein L34  100 
 
 
58 aa  113  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000000870464  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1194  ribosomal protein L34  70.69 
 
 
57 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000000642694  decreased coverage  0.000208827 
 
 
-
 
NC_002936  DET1043  50S ribosomal protein L34  73.33 
 
 
46 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000531959  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_914  ribosomal protein L34  73.33 
 
 
46 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000254245  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf883  ribosomal protein L34  63.83 
 
 
48 aa  62.4  0.000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0926  50S ribosomal protein L34  68.89 
 
 
46 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320545  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3852  ribosomal protein L34  62.5 
 
 
52 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1423  ribosomal protein L34  74 
 
 
57 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575426  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3967  ribosomal protein L34  74 
 
 
57 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.104672  normal  0.084456 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1628  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 
44 aa  56.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.499577  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4908  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 
44 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4116  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 
44 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0205607  normal  0.0561719 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3034  ribosomal protein L34  67.44 
 
 
44 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3489  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682.1  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 
44 aa  56.2  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2763  ribosomal protein L34  58.33 
 
 
52 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000022911  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4245  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 
44 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000109099  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1055  ribosomal protein L34  58.33 
 
 
51 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15136  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2924  50S ribosomal protein L34  56.86 
 
 
53 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916972  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2334  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 
44 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0446  50S ribosomal protein L34  56.25 
 
 
51 aa  54.3  0.0000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4370  ribosomal protein L34  58.14 
 
 
44 aa  53.9  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.09492  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0100  50S ribosomal protein L34  56.25 
 
 
53 aa  53.9  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  58.33 
 
 
55 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4432  50S ribosomal protein L34  56.82 
 
 
49 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3117  50S ribosomal protein L34  58.7 
 
 
47 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000116193  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3545  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 
44 aa  52.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4868  ribosomal protein L34  56.52 
 
 
47 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000339328  hitchhiker  0.00961108 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4796  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 
44 aa  52.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4143  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 
44 aa  52.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5015  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 
44 aa  52.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0656  50S ribosomal protein L34  60.87 
 
 
50 aa  52.4  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5302  50S ribosomal protein L34  58.14 
 
 
44 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4204  50S ribosomal protein L34  58.14 
 
 
44 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000294632  decreased coverage  0.00182284 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2827  50S ribosomal protein L34P  55.81 
 
 
44 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0870  50S ribosomal protein L34  58.14 
 
 
44 aa  52.4  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2558  ribosomal protein L34  57.78 
 
 
45 aa  52  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000028537  normal  0.271528 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4388  ribosomal protein L34  55.81 
 
 
44 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000381173 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  58.7 
 
 
52 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6059  50S ribosomal protein L34  58.14 
 
 
44 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0823674  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  62.79 
 
 
44 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1330  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 
44 aa  51.6  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000138476  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2132  50S ribosomal protein L34  52.94 
 
 
53 aa  51.2  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189497  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1356  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 
44 aa  51.6  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0134833  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0220  50S ribosomal protein L34P  54.35 
 
 
51 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2414  50S ribosomal protein L34  59.52 
 
 
44 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000429596  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2743  50S ribosomal protein L34  52.94 
 
 
53 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  60.87 
 
 
52 aa  50.8  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2033  50S ribosomal protein L34  57.78 
 
 
51 aa  50.8  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.778923  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0134  50S ribosomal protein L34  58.7 
 
 
52 aa  50.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4700  50S ribosomal protein L34P  55.56 
 
 
45 aa  50.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271583  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1543  ribosomal protein L34  58.7 
 
 
52 aa  50.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.185024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4225  ribosomal protein L34  55.56 
 
 
45 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4548  50S ribosomal protein L34  55.56 
 
 
45 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0003403  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2512  50S ribosomal protein L34  56.82 
 
 
45 aa  50.4  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197783  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  56.52 
 
 
47 aa  50.4  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2238  ribosomal protein L34  60.47 
 
 
44 aa  50.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.773424  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1787  50S ribosomal protein L34  58.14 
 
 
44 aa  50.4  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0214193  normal  0.25456 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2088  50S ribosomal protein L34  58.14 
 
 
44 aa  50.4  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149936  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27040  LSU ribosomal protein L34P  55.56 
 
 
45 aa  50.4  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2414  ribosomal protein L34  60.47 
 
 
44 aa  50.1  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00945499  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  58.14 
 
 
44 aa  50.1  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4864  ribosomal protein L34  58.14 
 
 
47 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4243  ribosomal protein L34  58.14 
 
 
47 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0239803  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  60.47 
 
 
44 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 
46 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4513  ribosomal protein L34  53.33 
 
 
45 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334556 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 
44 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  60.47 
 
 
44 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000155667  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2564  50S ribosomal protein L34  53.33 
 
 
53 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2038  ribosomal protein L34  60.47 
 
 
44 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 
46 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7341  50S ribosomal protein L34  53.33 
 
 
45 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0009  50S ribosomal protein L34  58.14 
 
 
44 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2400  50S ribosomal protein L34  53.06 
 
 
51 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.84341  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0001  50S ribosomal protein L34  58.14 
 
 
44 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.549372  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3461  50S ribosomal protein L34  58.14 
 
 
44 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3089  ribosomal protein L34  55.81 
 
 
44 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3760  50S ribosomal protein L34  58.14 
 
 
44 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4361  50S ribosomal protein L34  58.14 
 
 
49 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6487  50S ribosomal protein L34  55.56 
 
 
45 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00156279  normal  0.0851435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  58.14 
 
 
44 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5415  50S ribosomal protein L34  53.33 
 
 
45 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 
44 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2161  50S ribosomal protein L34  53.33 
 
 
45 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3626  50S ribosomal protein L34  55.81 
 
 
49 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118828  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4517  50S ribosomal protein L34  58.14 
 
 
49 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  55.32 
 
 
48 aa  49.3  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4498  50S ribosomal protein L34  58.14 
 
 
49 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3321  50S ribosomal protein L34P  59.52 
 
 
44 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2147  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 
44 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  2.00251e-17  unclonable  0.00000111229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3463  50S ribosomal protein L34  55.81 
 
 
44 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00766604  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4618  50S ribosomal protein L34  56.82 
 
 
46 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0002  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 
44 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000727123  unclonable  0.0000468434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  53.49 
 
 
44 aa  48.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31980  LSU ribosomal protein L34P  53.33 
 
 
45 aa  48.1  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2594  50S ribosomal protein L34  57.78 
 
 
45 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2524  ribosomal protein L34  59.09 
 
 
53 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.480913  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  55.81 
 
 
44 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0001  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 
44 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283755  hitchhiker  0.00000000552795 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3828  50S ribosomal protein L34P  60.98 
 
 
44 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>