16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0535 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0535  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  310  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0977  Rad52/22 double-strand break repair protein  37.04 
 
 
201 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.00000000168807  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2611  Rad52/22 double-strand break repair protein  39.69 
 
 
238 aa  91.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2527  Rad52/22 double-strand break repair protein  36.64 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00242809  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1173  hypothetical protein  33.07 
 
 
211 aa  67  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000729431  normal  0.496656 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0052  putative prophage protein  31.4 
 
 
282 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.012266 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0086  prophage protein  30.51 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0080  prophage protein  30.51 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.568604  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0565  RAD52/22 double-strand break repair protein  32.35 
 
 
169 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.103803 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0612  gp49  31.82 
 
 
235 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0180237  hitchhiker  0.00151942 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2129  hypothetical protein  29.81 
 
 
252 aa  48.9  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0576  hypothetical protein  28.86 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00845502  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3545  RAD52/22 double-strand break repair protein  28.24 
 
 
170 aa  48.5  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000561994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0517  Rad52/22 double-strand break repair protein  31.09 
 
 
167 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.743906  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1314  Rad52/22 double-strand break repair protein  30.08 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.321327  normal  0.202591 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0322  hypothetical protein  26.72 
 
 
242 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>