More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0477 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 126 aa  259  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3680  ribosome-binding factor A  44.09 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00259102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3752  ribosome-binding factor A  44.17 
 
 		 130 aa  110  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00104734  unclonable  0.0000134979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1131  ribosome-binding factor A  44.54 
 
 		 130 aa  110  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0305445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  43.52 
 
 		 131 aa  103  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  44.44 
 
 		 123 aa  103  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  43.12 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  45.87 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  43.24 
 
 		 118 aa  100  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 118 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 118 aa  100  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 118 aa  100  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 118 aa  100  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  41.28 
 
 		 126 aa  100  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 118 aa  100  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 118 aa  100  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  39.81 
 
 		 119 aa  99.4  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  40.91 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  40.91 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  40.91 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1511  ribosome-binding factor A  39.29 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.898255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  38.89 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  42.98 
 
 		 129 aa  98.2  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  44.35 
 
 		 125 aa  97.4  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  40.18 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  38.94 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  40.54 
 
 		 117 aa  96.7  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  39.34 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  43.8 
 
 		 128 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  39.34 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  39.34 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  39.34 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  39.09 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  48.04 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  41.23 
 
 		 122 aa  94  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  37.69 
 
 		 138 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  39.45 
 
 		 118 aa  92  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  39.83 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  43.44 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  41.96 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  37.69 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  40.48 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  43.36 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  40.68 
 
 		 142 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  41.82 
 
 		 123 aa  89.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1020  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1212  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.316878  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  34.26 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  39.09 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23440  ribosome-binding factor A  42.71 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.487539  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  39.06 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  40.62 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  39.34 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  38.6 
 
 		 147 aa  87  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  47.87 
 
 		 119 aa  87  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  41.84 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  42.39 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3347  ribosome-binding factor A  39.29 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10330  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 169 aa  85.5  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.150571  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  35.45 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1445  ribosome-binding factor A  37.39 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.084347  normal  0.20066 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  33.63 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  37.72 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  37.72 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 156 aa  84.3  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  39.82 
 
 		 130 aa  84.3  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  37.82 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  37.11 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  40.94 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  36.15 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  38.17 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  40.94 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  40.94 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  40.94 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  42 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  40.94 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3604  ribosome-binding factor A  40.94 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  42 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  40.94 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  40.94 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  40.94 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  40.94 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  40.94 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  45.26 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2118  Ribosome-binding factor A-like protein  35.51 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.376562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  40.16 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1184  ribosome-binding factor A  35.45 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.352255 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3642  ribosome-binding factor A  40.94 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  37.82 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3474  ribosome-binding factor A  40.94 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  34.86 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1427  ribosome-binding factor A  39.58 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000533542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>