More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0412 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0412  FeS assembly protein SufD  100 
 
 
396 aa  799    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  45.79 
 
 
404 aa  330  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  42.71 
 
 
405 aa  317  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  42.41 
 
 
405 aa  316  5e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  33.57 
 
 
434 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0496  FeS assembly protein SufD  29.43 
 
 
466 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  30.19 
 
 
444 aa  184  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0378  SufBD protein  29.31 
 
 
403 aa  179  7e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0643358  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  26.39 
 
 
455 aa  176  8e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  31.49 
 
 
435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  28.71 
 
 
453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  28.12 
 
 
450 aa  173  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0174  SufBD protein  28.76 
 
 
404 aa  167  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  32.91 
 
 
420 aa  163  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2920  SufBD protein  29.51 
 
 
403 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.689124  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  27.64 
 
 
435 aa  158  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  29.3 
 
 
475 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2430  SufBD protein  29.24 
 
 
408 aa  157  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  27.14 
 
 
435 aa  155  9e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  27.14 
 
 
435 aa  155  9e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1502  SufBD protein  29.09 
 
 
406 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  27.3 
 
 
440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0987  SufBD protein  26.12 
 
 
423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137837  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0219  hypothetical protein  27.32 
 
 
420 aa  153  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  31.78 
 
 
446 aa  153  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  26.28 
 
 
439 aa  152  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  28.39 
 
 
476 aa  152  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  28.67 
 
 
445 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  30.91 
 
 
430 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  28.9 
 
 
476 aa  151  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  29.62 
 
 
476 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2922  FeS assembly protein SufD  30.9 
 
 
437 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3073  FeS assembly protein SufD  27.66 
 
 
436 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  30.63 
 
 
430 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  28.44 
 
 
428 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  25.24 
 
 
470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  30.63 
 
 
430 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  30.63 
 
 
430 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  28.03 
 
 
475 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  30.63 
 
 
430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  30.63 
 
 
430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  30.63 
 
 
430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  30.63 
 
 
430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1206  FeS assembly protein SufB  26.84 
 
 
470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0384919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  30.63 
 
 
430 aa  146  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  30.63 
 
 
430 aa  146  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  28.34 
 
 
469 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  27.39 
 
 
467 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1840  FeS assembly protein SufB  28.8 
 
 
474 aa  145  8.000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  30.33 
 
 
430 aa  145  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  29.46 
 
 
441 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  28.25 
 
 
476 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  27.73 
 
 
439 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0142  hypothetical protein  25.73 
 
 
420 aa  144  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  28.21 
 
 
463 aa  144  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  25.78 
 
 
479 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0892  FeS assembly protein SufD  24.34 
 
 
429 aa  143  5e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  26.62 
 
 
471 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  25.54 
 
 
552 aa  142  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  25.85 
 
 
485 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  27.27 
 
 
479 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  25.85 
 
 
479 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  25.29 
 
 
487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  25.85 
 
 
487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  25.29 
 
 
487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  25.29 
 
 
487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  25 
 
 
470 aa  140  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  26.12 
 
 
445 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  27.63 
 
 
437 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2037  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  26.81 
 
 
394 aa  141  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  28.43 
 
 
487 aa  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  25.3 
 
 
471 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  29.63 
 
 
437 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  27.83 
 
 
471 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  25.85 
 
 
482 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  25.12 
 
 
472 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  24.71 
 
 
465 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  23.54 
 
 
469 aa  138  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1973  hypothetical protein  27.54 
 
 
418 aa  138  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  27.4 
 
 
481 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  25.54 
 
 
485 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  31.25 
 
 
454 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  24.28 
 
 
469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  26.92 
 
 
464 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  26.92 
 
 
464 aa  137  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  27.92 
 
 
446 aa  136  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  26.52 
 
 
445 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.03 
 
 
470 aa  136  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  27.24 
 
 
467 aa  136  8e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  25.36 
 
 
499 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.02 
 
 
490 aa  135  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1969  hypothetical protein  24.88 
 
 
470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  24.41 
 
 
475 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  30.98 
 
 
437 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  25.36 
 
 
481 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  29.58 
 
 
437 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  25.12 
 
 
473 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1113  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  26.05 
 
 
426 aa  133  3.9999999999999996e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185623  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  27.24 
 
 
472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  26.7 
 
 
466 aa  133  5e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>