More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0408 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0408  NifU family SUF system FeS assembly protein  100 
 
 
131 aa  267  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0957  SUF system FeS assembly protein, NifU family  58.91 
 
 
130 aa  163  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  58.78 
 
 
132 aa  159  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  57.25 
 
 
132 aa  157  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1695  SUF system FeS assembly protein, NifU family  53.54 
 
 
128 aa  147  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1226  SUF system FeS assembly protein, NifU family  50.43 
 
 
163 aa  130  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1252  SUF system FeS assembly protein, NifU family  49.14 
 
 
143 aa  127  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0219  SUF system FeS assembly protein, NifU family  49.57 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1833  SUF system FeS assembly protein, NifU family  49.58 
 
 
143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5396  nitrogen-fixing NifU domain protein  48 
 
 
137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2247  SUF system FeS assembly protein, NifU family  48.72 
 
 
140 aa  117  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  42.11 
 
 
140 aa  115  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0498  NifU family SUF system FeS assembly protein  47.46 
 
 
147 aa  107  5e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.48 
 
 
151 aa  106  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  42.34 
 
 
149 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  42.34 
 
 
149 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1321  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.83 
 
 
142 aa  105  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.927715  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  40.69 
 
 
150 aa  104  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  40.46 
 
 
151 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  40 
 
 
149 aa  100  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.78 
 
 
148 aa  99.4  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  37.78 
 
 
158 aa  99.4  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  40.43 
 
 
154 aa  98.6  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  38.41 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0314  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.96 
 
 
134 aa  97.4  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.764118  normal  0.0431709 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.59 
 
 
153 aa  97.1  7e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.31 
 
 
154 aa  95.9  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.31 
 
 
154 aa  95.9  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  39.1 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0700  SUF system FeS assembly protein  39.58 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  40.52 
 
 
127 aa  95.5  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0207  SUF system FeS assembly protein  40 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  39.42 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  40.18 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.38 
 
 
159 aa  94  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.38 
 
 
159 aa  94  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  39.81 
 
 
144 aa  94  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  38.79 
 
 
149 aa  93.6  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2920  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.97 
 
 
145 aa  93.6  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  38.79 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.16 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1716  NifU-like domain-containing protein  37.12 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0759049  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.31 
 
 
141 aa  92  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0609  NifU-like domain-containing protein  37.12 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2886  NifU-like domain-containing protein  37.12 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2827  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.12 
 
 
163 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2707  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.12 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2403  NifU-like domain-containing protein  37.12 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2764  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.12 
 
 
163 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541275  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.57 
 
 
149 aa  92  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3071  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.97 
 
 
149 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  38.79 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  40.18 
 
 
125 aa  90.5  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2531  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.23 
 
 
148 aa  90.5  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.17 
 
 
135 aa  90.1  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  39.25 
 
 
145 aa  90.1  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  37.93 
 
 
173 aa  89.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  36.23 
 
 
149 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  37.07 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  37.07 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.12 
 
 
165 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  40 
 
 
125 aa  89  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  34.09 
 
 
163 aa  88.2  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  38.89 
 
 
143 aa  88.2  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  38.74 
 
 
131 aa  88.6  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0719  NifU domain-containing protein  40.18 
 
 
129 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0403016  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.51 
 
 
149 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  40.18 
 
 
124 aa  88.2  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  39.25 
 
 
129 aa  88.2  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.51 
 
 
149 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  38.14 
 
 
146 aa  87.8  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.07 
 
 
207 aa  87.8  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  36.11 
 
 
160 aa  87.8  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.23 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1570  NifU domain-containing protein  42.7 
 
 
144 aa  87.4  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0108817  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.93 
 
 
137 aa  86.7  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2387  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.77 
 
 
154 aa  86.7  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.53 
 
 
155 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.93 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1864  SUF system FeS assembly protein  39.1 
 
 
162 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.861958  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2505  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.76 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2268  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.53 
 
 
163 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2447  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.81 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0284902 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  39.05 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1070  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.96 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0953  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.09 
 
 
128 aa  84.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  38.74 
 
 
122 aa  84.3  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0652  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.13 
 
 
145 aa  84.3  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  34.33 
 
 
172 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.25 
 
 
153 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.07 
 
 
138 aa  84  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.07 
 
 
138 aa  84  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.33 
 
 
150 aa  83.6  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1982  SUF system FeS assembly protein  36.62 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2194  SUF system FeS assembly protein  41.23 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.84 
 
 
151 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0729  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.96 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230708  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.59 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1139  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.11 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.039211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.78 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000771916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>