226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0386 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  100 
 
 
125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  57.98 
 
 
141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  61.54 
 
 
145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  64.91 
 
 
136 aa  144  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  58.82 
 
 
142 aa  143  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  59.83 
 
 
156 aa  142  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  60.53 
 
 
150 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  60.5 
 
 
126 aa  142  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  64.29 
 
 
128 aa  141  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  61.86 
 
 
131 aa  141  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  61.34 
 
 
126 aa  140  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  61.54 
 
 
142 aa  140  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  60.68 
 
 
127 aa  139  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  60.68 
 
 
127 aa  139  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  60.71 
 
 
139 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2220  aspartate 1-decarboxylase  62.28 
 
 
128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  58.82 
 
 
126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  57.63 
 
 
135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  57.14 
 
 
134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  60.68 
 
 
127 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3425  aspartate 1-decarboxylase  61.4 
 
 
138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  60.34 
 
 
128 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  59.83 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  60.53 
 
 
150 aa  137  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3676  aspartate alpha-decarboxylase  58.97 
 
 
141 aa  135  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  59.65 
 
 
131 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  58.77 
 
 
131 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  60.91 
 
 
135 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  58.77 
 
 
131 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0156  aspartate alpha-decarboxylase  63.39 
 
 
127 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000166486  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1864  aspartate 1-decarboxylase  54.24 
 
 
132 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1838  aspartate 1-decarboxylase  54.24 
 
 
132 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2095  aspartate 1-decarboxylase  58.62 
 
 
145 aa  134  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0195  aspartate 1-decarboxylase  57.26 
 
 
141 aa  133  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.129309 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35540  L-aspartate 1-decarboxylase  57.89 
 
 
165 aa  133  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.154487  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  56.3 
 
 
139 aa  133  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2150  aspartate alpha-decarboxylase  56.41 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  58.93 
 
 
135 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  62.28 
 
 
141 aa  132  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  59.65 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  58.04 
 
 
135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3887  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 
142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  58.04 
 
 
135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  58.04 
 
 
135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  58.97 
 
 
127 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  55.83 
 
 
131 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  54.7 
 
 
127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 
127 aa  130  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2116  aspartate alpha-decarboxylase  56.41 
 
 
127 aa  130  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 
127 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 
127 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 
127 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 
127 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 
127 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 
127 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 
127 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 
127 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4391  aspartate 1-decarboxylase  58.12 
 
 
138 aa  129  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.472386  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  57.26 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  58.04 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0118  aspartate 1-decarboxylase  54.17 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.748235  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1519  aspartate 1-decarboxylase  59.65 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0102  aspartate 1-decarboxylase  59.13 
 
 
133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0142  aspartate alpha-decarboxylase  59.32 
 
 
128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0503  aspartate alpha-decarboxylase  56 
 
 
127 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  58.04 
 
 
132 aa  127  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  58.12 
 
 
127 aa  127  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32000  L-aspartate 1-decarboxylase  56 
 
 
151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0636  aspartate 1-decarboxylase  58.26 
 
 
155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1112  aspartate 1-decarboxylase  55.65 
 
 
154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26125  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0064  aspartate alpha-decarboxylase  53.57 
 
 
115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.518094  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0364  aspartate 1-decarboxylase  61.4 
 
 
135 aa  127  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01435  aspartate 1-decarboxylase precursor  55.26 
 
 
116 aa  127  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  56.78 
 
 
134 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  55.93 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  51.61 
 
 
128 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  57.98 
 
 
135 aa  124  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  51.61 
 
 
128 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  51.61 
 
 
128 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  51.61 
 
 
128 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  51.61 
 
 
128 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  51.61 
 
 
128 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0341  aspartate alpha-decarboxylase  56.14 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2198  aspartate alpha-decarboxylase  50.81 
 
 
128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0319  aspartate alpha-decarboxylase  56.14 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  50.81 
 
 
128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  57.02 
 
 
116 aa  124  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.200169 
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  59.81 
 
 
118 aa  123  7e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4006  aspartate 1-decarboxylase  60.34 
 
 
144 aa  123  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  50.81 
 
 
128 aa  123  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  49.59 
 
 
135 aa  123  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3533  aspartate alpha-decarboxylase  54.62 
 
 
131 aa  123  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00679712  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2055  aspartate alpha-decarboxylase  49.59 
 
 
126 aa  122  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.552019  normal  0.161743 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1828  aspartate alpha-decarboxylase  50.4 
 
 
131 aa  122  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.683514  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
128 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0334  aspartate alpha-decarboxylase  53.1 
 
 
121 aa  122  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
128 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
128 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3688  aspartate alpha-decarboxylase  53.64 
 
 
114 aa  122  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.177527 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0135  aspartate 1-decarboxylase  54.39 
 
 
116 aa  122  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>