More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0384 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  100 
 
 
222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.97 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  37.96 
 
 
218 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  34.48 
 
 
213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  34.93 
 
 
232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.71 
 
 
227 aa  118  7e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3084  HAD family hydrolase  36.74 
 
 
219 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.5 
 
 
213 aa  116  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.66 
 
 
216 aa  114  8.999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  30.67 
 
 
236 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  36.07 
 
 
222 aa  111  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2641  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.07 
 
 
222 aa  111  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  32.7 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1355  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.09 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  35.02 
 
 
230 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  34.86 
 
 
219 aa  108  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  32.87 
 
 
224 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1518  HAD family hydrolase  32.88 
 
 
226 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0020263  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  34.74 
 
 
231 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  35.47 
 
 
217 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  31.94 
 
 
224 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.25 
 
 
232 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.998223  normal  0.137923 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0820  HAD family hydrolase  34.4 
 
 
219 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362734  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  32.09 
 
 
234 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0484  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.05 
 
 
218 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  30.66 
 
 
232 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.11 
 
 
218 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
231 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  31.94 
 
 
224 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  32.88 
 
 
216 aa  105  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.87 
 
 
220 aa  105  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  29.22 
 
 
238 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  31.58 
 
 
234 aa  105  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  33.94 
 
 
220 aa  104  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  27.15 
 
 
227 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  31.05 
 
 
212 aa  104  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1323  HAD family hydrolase  32.44 
 
 
218 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00010916  normal  0.934661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  35.02 
 
 
230 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5280  HAD family hydrolase  34.58 
 
 
228 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94241  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1778  HAD family hydrolase  34.8 
 
 
222 aa  102  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  decreased coverage  0.0000822361 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1175  HAD family hydrolase  32.88 
 
 
222 aa  101  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341694  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.65 
 
 
219 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00300829  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  33.64 
 
 
215 aa  101  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1064  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.11 
 
 
219 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259823  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4786  HAD family hydrolase  33.94 
 
 
225 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.480444 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.72 
 
 
222 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  32.27 
 
 
230 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1380  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.56 
 
 
223 aa  99.8  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  26.36 
 
 
225 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  31.9 
 
 
223 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  30.66 
 
 
233 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  31.51 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1042  putative phosphoglycolate phosphatase protein  34.09 
 
 
219 aa  99.4  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0803838  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  29.39 
 
 
228 aa  99.4  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.73 
 
 
232 aa  99.4  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  30.7 
 
 
234 aa  99  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  32.09 
 
 
219 aa  98.6  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  30.95 
 
 
234 aa  98.2  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  29.91 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  28.99 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  28.99 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  26.36 
 
 
227 aa  96.7  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  28.99 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  28.02 
 
 
253 aa  97.1  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  28.99 
 
 
252 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  28.99 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  30.35 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  29.86 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  30.56 
 
 
232 aa  96.7  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 
233 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  29.58 
 
 
216 aa  95.9  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  27.85 
 
 
226 aa  95.5  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 
226 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  29.18 
 
 
252 aa  95.1  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1722  HAD family hydrolase  33.03 
 
 
228 aa  95.1  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  29.79 
 
 
216 aa  95.1  8e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 
231 aa  94.7  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  29.18 
 
 
252 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  29.18 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  29.18 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  29.18 
 
 
252 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  29.61 
 
 
222 aa  94  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  29.18 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  29.18 
 
 
252 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  27.19 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  29.18 
 
 
252 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  29.02 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  30.09 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
215 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  30.85 
 
 
238 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4164  HAD family hydrolase  33.7 
 
 
193 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0540485  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  28.76 
 
 
252 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
215 aa  94  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  29.02 
 
 
227 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1640  HAD family hydrolase  32.09 
 
 
220 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  26.05 
 
 
225 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>