More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0370 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0370  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 497 aa  1016    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.735975  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.75 
 
 		 520 aa  205  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  29.68 
 
 		 527 aa  184  3e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  33 
 
 		 522 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.02 
 
 		 525 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  30.8 
 
 		 545 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  31.52 
 
 		 522 aa  177  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04510  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.48 
 
 		 551 aa  172  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0337  extracellular solute-binding protein family 5  27.41 
 
 		 521 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.82 
 
 		 524 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  27.61 
 
 		 519 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2595  putative extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 507 aa  156  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 512 aa  156  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  28.93 
 
 		 527 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5725  extracellular solute-binding protein family 5  26.42 
 
 		 519 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  27.91 
 
 		 509 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 565 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 537 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  30.39 
 
 		 516 aa  140  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1341  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 		 500 aa  137  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3809  extracellular solute-binding protein family 5  29.28 
 
 		 521 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  28.6 
 
 		 524 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  28.28 
 
 		 533 aa  133  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  27.19 
 
 		 517 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  27.93 
 
 		 576 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.4 
 
 		 546 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  27.57 
 
 		 523 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.52 
 
 		 535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.27 
 
 		 520 aa  131  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0227  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0221  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2017  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 523 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0245155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0360  extracellular solute-binding protein family 5  28.67 
 
 		 506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  27.67 
 
 		 534 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3559  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 		 526 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04010  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.23 
 
 		 548 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.115797  normal  0.0514058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3842  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 568 aa  128  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0450891  normal  0.108057 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.94 
 
 		 534 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.5 
 
 		 518 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 538 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 540 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 		 509 aa  124  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1994  ABC transporter, substrate-binding protein  24.9 
 
 		 491 aa  124  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.09 
 
 		 510 aa  124  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  26.01 
 
 		 535 aa  124  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 535 aa  123  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  28.11 
 
 		 545 aa  122  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 528 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 595 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  25.43 
 
 		 531 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3169  extracellular solute-binding protein family 5  29.13 
 
 		 529 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  29.57 
 
 		 516 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  28.07 
 
 		 518 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.87 
 
 		 505 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  26.19 
 
 		 518 aa  121  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.45 
 
 		 538 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.71 
 
 		 540 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  27.65 
 
 		 529 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.14 
 
 		 512 aa  120  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 		 516 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 505 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  29.36 
 
 		 514 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  25.1 
 
 		 535 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 528 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2223  extracellular solute-binding protein family 5  26.56 
 
 		 502 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 536 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 		 516 aa  118  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  27.77 
 
 		 526 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1518  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  25.41 
 
 		 538 aa  117  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000374669  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 549 aa  117  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  27.68 
 
 		 495 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51940  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 		 510 aa  116  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000130332  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 539 aa  116  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1044  extracellular solute-binding protein family 5  26.36 
 
 		 496 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0364384  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  26.47 
 
 		 531 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.17 
 
 		 589 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.14 
 
 		 508 aa  116  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  26.56 
 
 		 524 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  26.04 
 
 		 509 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  26.17 
 
 		 514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.39 
 
 		 504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  26.24 
 
 		 629 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  28.99 
 
 		 509 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  25.69 
 
 		 519 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  26.54 
 
 		 517 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  25.47 
 
 		 529 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  27.95 
 
 		 527 aa  115  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.07 
 
 		 544 aa  114  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  26.2 
 
 		 563 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0960  extracellular solute-binding protein family 5  26.19 
 
 		 547 aa  114  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6371  extracellular solute-binding protein family 5  26.68 
 
 		 504 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2648  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 524 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 559 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 		 531 aa  114  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1621  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.61 
 
 		 594 aa  114  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  27.06 
 
 		 529 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  28.05 
 
 		 533 aa  114  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>