More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0357 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0357  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000241267  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2512  fatty acid metabolism regulator  39.82 
 
 		 249 aa  176  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000912913  normal  0.579868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2689  fatty acid metabolism regulator  39.82 
 
 		 249 aa  175  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449481  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1743  fatty acid metabolism regulator  39.91 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2174  fatty acid metabolism regulator  38.77 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000030216  normal  0.0239474 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0623  fatty acid metabolism regulator  36.44 
 
 		 239 aa  171  7.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000168386  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2438  fatty acid metabolism regulator  40.91 
 
 		 239 aa  171  9e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000509997  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2109  fatty acid metabolism regulator  39.73 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109018  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2363  fatty acid metabolism regulator  39.73 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000339682  normal  0.326287 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1999  fatty acid metabolism regulator  39.73 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00814717  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1924  fatty acid metabolism regulator  42.78 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000876108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2617  regulatory protein GntR HTH  37.5 
 
 		 230 aa  167  9e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01162  fatty acid metabolism regulator  37.78 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000799515  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2438  fatty acid metabolism regulator  37.78 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000216625  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2461  fatty acid metabolism transcriptional regulator FadR  37.78 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000004944  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1513  fatty acid metabolism regulator  37.78 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.127061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1345  fatty acid metabolism regulator  37.78 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00238872  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1290  fatty acid metabolism regulator  37.78 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557847  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1943  fatty acid metabolism regulator  37.78 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0247778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01172  hypothetical protein  37.78 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000480756  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1962  fatty acid metabolism regulator  37.78 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000133841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1947  fatty acid metabolism regulator  37.78 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0438592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1674  fatty acid metabolism regulator  37.78 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000616517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1328  fatty acid metabolism regulator  37.78 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224704  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2003  fatty acid metabolism regulator  37.78 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1332  fatty acid metabolism regulator  37.78 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000305633  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3488  fatty acid metabolism regulator  39.72 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00186982  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5646  regulatory protein GntR HTH  37.67 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2365  fatty acid metabolism regulator  37.33 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000203201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2794  fatty acid metabolism regulator  39.7 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00556903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1815  fatty acid metabolism regulator  41.12 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.682144 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1948  fatty acid metabolism regulator  42.41 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00527579  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2244  fatty acid metabolism regulator  41.88 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0118438  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1771  fatty acid metabolism regulator  41.12 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000343571  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2507  fatty acid metabolism regulator  41.12 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1778  fatty acid metabolism regulator  41.12 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000719025  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01148  fatty acid metabolism regulator  39.8 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0433911  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1635  fatty acid metabolism regulator  40.61 
 
 		 239 aa  161  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000115144  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1983  fatty acid metabolism regulator  41.36 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0199399  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2003  fatty acid metabolism regulator  41.36 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000120819  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1683  fatty acid metabolism regulator  40.1 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000333704  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2885  fatty acid metabolism regulator  39.59 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1643  fatty acid metabolism regulator  39.59 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000083399  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1568  fatty acid metabolism regulator  39.59 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000521117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1635  fatty acid metabolism regulator  39.59 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000615714  normal  0.0628183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2748  fatty acid metabolism regulator  36.53 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000401699  decreased coverage  0.0000363622 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2087  fatty acid responsive transcription factor FadR domain protein  33.94 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30946e-19 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1661  fatty acid metabolism regulator  34.38 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0855025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2130  regulatory protein GntR HTH  34.27 
 
 		 233 aa  142  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0857174  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02929  fatty acid metabolism regulator  31.27 
 
 		 279 aa  132  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1490  fatty acid metabolism regulator  32.91 
 
 		 279 aa  128  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002979  transcriptional regulator for fatty acid degradation FadR GntR family  33.33 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2147  fatty acid metabolism regulator  29.67 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102966  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10597  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0011  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2757  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.578268  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2942  regulatory protein GntR, HTH  31.9 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0684718  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2727  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.45563  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2771  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0277  regulatory protein GntR HTH  41.76 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6769  regulatory protein GntR HTH  26.09 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  28.92 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4488  regulatory protein GntR HTH  28.35 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0854  GntR domain protein  27.43 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00310833  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  49.28 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  47.37 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5072  GntR domain-containing protein  32.1 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  47.37 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  30.86 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0479  GntR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3569  transcriptional regulator PdhR  47.37 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  47.37 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  47.37 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  47.37 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7456  regulatory protein GntR HTH  38.71 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0768739  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  45 
 
 		 246 aa  62  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5125  GntR domain-containing protein  30.86 
 
 		 234 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 230 aa  62  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  45 
 
 		 246 aa  62  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  45 
 
 		 250 aa  62  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2539  transcriptional regulator  34.9 
 
 		 229 aa  62  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.824223  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  46.05 
 
 		 254 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  46.05 
 
 		 254 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  46.05 
 
 		 254 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  46.05 
 
 		 254 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  46.05 
 
 		 254 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  28.74 
 
 		 253 aa  62  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00112  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  46.05 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0480  regulatory protein GntR HTH  25.1 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143431  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  46.05 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3708  transcriptional regulator NanR  25.1 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.012881  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3414  transcriptional regulator NanR  25.1 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111616  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4543  transcriptional regulator NanR  25.1 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3213  GntR-like  31.48 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  46.05 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  46.05 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  46.05 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  46.05 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>