19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0199 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0199  DinB family protein  100 
 
 
165 aa  342  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000248832  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1980  DinB  30.19 
 
 
170 aa  48.5  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.650052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5237  protein DinB  26.03 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0354282  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2595  DinB family protein  27.52 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2186  DinB family protein  24.42 
 
 
176 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3885  DinB family protein  25.32 
 
 
167 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3762  DinB family protein  28.86 
 
 
169 aa  44.3  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3043  DinB family protein  28.19 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1562  DinB family protein  25.85 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3614  hypothetical protein  28.48 
 
 
186 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.500275  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2470  DinB family protein  25.32 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0700506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3562  hypothetical protein  26.45 
 
 
187 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3424  DinB family protein  26.67 
 
 
192 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3519  DinB family protein  25.49 
 
 
187 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.888267  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0693  hypothetical protein  27.71 
 
 
170 aa  42  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2202  DinB family protein  36.36 
 
 
173 aa  42  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0131382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2580  DinB  27.5 
 
 
193 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.747575  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3224  DinB family protein  26.8 
 
 
187 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0684  hypothetical protein  27.11 
 
 
170 aa  40.4  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>