More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0140 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 174 aa  344  4e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  46.47 
 
 		 181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  49.11 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  49.7 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  42.29 
 
 		 175 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  43.37 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  43.03 
 
 		 172 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 174 aa  124  7e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  38.32 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  42.33 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  39.1 
 
 		 174 aa  121  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  39.1 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  38.29 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  40.49 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  37.64 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  37.64 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  37.35 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  40.35 
 
 		 166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  40.35 
 
 		 166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  39.75 
 
 		 170 aa  114  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  39.77 
 
 		 176 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  39.39 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  35.15 
 
 		 176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  36.54 
 
 		 174 aa  111  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  36.47 
 
 		 172 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  36.54 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  36.54 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  38.56 
 
 		 166 aa  110  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  38.56 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  38.56 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  38.56 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  38.56 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  38.56 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  38.56 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  38.56 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  38.56 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  38.99 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  34.5 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  40.76 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  37.89 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  35.29 
 
 		 173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1956  ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  37.91 
 
 		 166 aa  108  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  37.91 
 
 		 166 aa  108  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  35.39 
 
 		 178 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  37.43 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  36.02 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  36.02 
 
 		 176 aa  104  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  35.8 
 
 		 178 aa  104  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  36.02 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  37.14 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  39.08 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  35.29 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  39.13 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  35.67 
 
 		 186 aa  101  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  36.6 
 
 		 174 aa  101  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  34.97 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  34.97 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  39.74 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1174  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 174 aa  98.2  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000920712  normal  0.67375 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  35.09 
 
 		 166 aa  97.8  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  34.36 
 
 		 174 aa  97.8  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  35.09 
 
 		 166 aa  97.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  35.09 
 
 		 166 aa  97.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0640  50S ribosomal protein L10  36.84 
 
 		 169 aa  97.4  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  31.93 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  35.29 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  34.76 
 
 		 166 aa  95.9  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  34.36 
 
 		 181 aa  95.5  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  36.97 
 
 		 173 aa  95.9  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  39.19 
 
 		 173 aa  95.1  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4011  ribosomal protein L10  33.73 
 
 		 175 aa  95.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0274883  hitchhiker  0.0000000471613 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  36.65 
 
 		 172 aa  94.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  33.74 
 
 		 174 aa  94.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  33.72 
 
 		 171 aa  94.4  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  34.52 
 
 		 175 aa  94  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  35.58 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  36.02 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  35.12 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  34.16 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  34.78 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  34.76 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0569  50S ribosomal protein L10  35.37 
 
 		 172 aa  92  4e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000818206  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1038  50S ribosomal protein L10  34.57 
 
 		 183 aa  91.7  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1738  50S ribosomal protein L10  31.85 
 
 		 189 aa  92  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0265  50S ribosomal protein L10  37.89 
 
 		 172 aa  92  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1762  50S ribosomal protein L10  31.85 
 
 		 189 aa  92  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.232126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1043  ribosomal protein L10  37.86 
 
 		 167 aa  91.7  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  34.12 
 
 		 172 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  34.16 
 
 		 195 aa  91.3  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  35.58 
 
 		 203 aa  91.3  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  33.52 
 
 		 175 aa  91.3  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 173 aa  91.3  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  34.78 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0412  50S ribosomal protein L10P  36.48 
 
 		 167 aa  90.5  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33563  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  34.78 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  34.78 
 
 		 228 aa  90.1  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  36.97 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2676  ribosomal protein L10  36.05 
 
 		 174 aa  90.1  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000001837  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>