More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0117 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0117  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 377 aa  767    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00105897  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3110  aminotransferase class I and II  59.04 
 
 		 381 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1560  aminotransferase, class I and II  55.2 
 
 		 385 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3411  aminotransferase class I and II  53.07 
 
 		 388 aa  391  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.193899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2288  aminotransferase  31.76 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0374  aminotransferase class I and II  38.27 
 
 		 411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3410  aminotransferase class I and II  37.83 
 
 		 392 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190651  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0061  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  36 
 
 		 421 aa  161  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0819  aminotransferase, class I/II  32.73 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1600  aminotransferase AlaT  26.99 
 
 		 404 aa  120  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0619302  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0619  aminotransferase AlaT  28.03 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2774  aminotransferase AlaT  25.61 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1490  aminotransferase AlaT  25.34 
 
 		 404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0167  aminotransferase AlaT  27.32 
 
 		 404 aa  110  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1676  aminotransferase AlaT  26.12 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000605131  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  24.38 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1872  aminotransferase AlaT  27.61 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1391  aminotransferase AlaT  25.07 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2136  aminotransferase AlaT  27.32 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000003299  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2248  aminotransferase AlaT  27.32 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000013752  hitchhiker  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4521  aminotransferase AlaT  27.32 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2235  aminotransferase AlaT  27.32 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000654312  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  27.32 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  27.32 
 
 		 404 aa  106  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  27.89 
 
 		 384 aa  106  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  28.62 
 
 		 405 aa  106  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3310  aminotransferase AlaT  24.8 
 
 		 404 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000424805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2553  aminotransferase AlaT  25.07 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1558  aminotransferase AlaT  26.81 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.302938  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1450  aminotransferase AlaT  26.81 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1311  aminotransferase AlaT  25.85 
 
 		 508 aa  105  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  28.21 
 
 		 404 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2267  aminotransferase AlaT  27.73 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0850565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1819  aminotransferase AlaT  26.81 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1097  aminotransferase AlaT  26.18 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.832418  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1164  aminotransferase AlaT  26.58 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136093 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0177  alanine aminotransferase  25.5 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.127101 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3820  predicted protein  27.67 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1697  aminotransferase AlaT  26.76 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00135773  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1914  aminotransferase AlaT  27.93 
 
 		 404 aa  103  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000233272  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0437  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  24.57 
 
 		 518 aa  103  6e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01427  aminotransferase AlaT  25.27 
 
 		 404 aa  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  26.76 
 
 		 404 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1803  aminotransferase class I and II  26.02 
 
 		 416 aa  102  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  25.94 
 
 		 404 aa  102  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15420  aminotransferase AlaT  26.11 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169298  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2471  aminotransferase AlaT  25.44 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00191502  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  27.09 
 
 		 379 aa  102  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2559  aminotransferase AlaT  25.44 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2034  aminotransferase AlaT  24.73 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2048  aminotransferase AlaT  26.4 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000163504  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2516  aminotransferase AlaT  25.44 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0408382  normal  0.443228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2571  aminotransferase AlaT  25.44 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7259  aminotransferase AlaT  27.56 
 
 		 404 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1201  aminotransferase AlaT  27.06 
 
 		 413 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.895209  normal  0.0291272 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1262  aminotransferase AlaT  26.73 
 
 		 429 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.30879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  26.09 
 
 		 409 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1458  aminotransferase  27.14 
 
 		 404 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2040  aminotransferase AlaT  26.2 
 
 		 404 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00341686  hitchhiker  0.00762729 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004034  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  26.02 
 
 		 377 aa  101  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  25 
 
 		 543 aa  100  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2145  aminotransferase AlaT  26.2 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0123768  normal  0.013049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  26.99 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0691  aminotransferase class I and II  25 
 
 		 410 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0228341  hitchhiker  0.0000000562842 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2834  aminotransferase AlaT  23.71 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0052694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2583  aminotransferase AlaT  26.69 
 
 		 405 aa  100  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.45985  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02215  aspartate aminotransferase  26.69 
 
 		 405 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1366  aminotransferase class I and II  26.69 
 
 		 405 aa  100  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.465492  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2666  aminotransferase AlaT  26.69 
 
 		 405 aa  100  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.180875  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02175  hypothetical protein  26.69 
 
 		 405 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1362  aminotransferase AlaT  26.69 
 
 		 405 aa  100  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.594502 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2445  aminotransferase AlaT  26.69 
 
 		 405 aa  100  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1973  aminotransferase, class I and II  27.22 
 
 		 429 aa  100  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2439  aminotransferase AlaT  26.69 
 
 		 405 aa  100  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2340  aminotransferase AlaT  27.17 
 
 		 404 aa  99.8  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599264  hitchhiker  0.0000284015 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3429  aminotransferase AlaT  26.69 
 
 		 405 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.412347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3232  aminotransferase AlaT  26.89 
 
 		 411 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00114602  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5220  aminotransferase AlaT  27.1 
 
 		 411 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0739506  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2483  aminotransferase AlaT  25.92 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  27.66 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2522  aminotransferase AlaT  26.11 
 
 		 403 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0098496  normal  0.421504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27500  aminotransferase AlaT  26.43 
 
 		 403 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0223  normal  0.0677346 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07490  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  24.86 
 
 		 403 aa  96.7  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3795  aminotransferase AlaT  28.62 
 
 		 410 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  26.07 
 
 		 413 aa  96.3  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  26.06 
 
 		 406 aa  96.3  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  24.62 
 
 		 409 aa  95.9  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3862  aminotransferase AlaT  28.29 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.693995 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  25.62 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1994  aminotransferase AlaT  24.57 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  27.15 
 
 		 401 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  24.4 
 
 		 404 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0437  aminotransferase AlaT  26.32 
 
 		 418 aa  94.4  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16560  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  24.93 
 
 		 505 aa  94  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0044181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16360  aminotransferase  25.71 
 
 		 412 aa  93.6  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01072  aminotransferase AlaT  24.12 
 
 		 406 aa  93.2  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2327  aminotransferase AlaT  25.8 
 
 		 403 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218058  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  28.27 
 
 		 402 aa  92.8  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  26.15 
 
 		 412 aa  92.8  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  26.06 
 
 		 406 aa  92.8  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>