187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0116 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 357 aa  703    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  40.78 
 
 		 385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2646  anti-sigma-factor antagonist  48.32 
 
 		 261 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  43.36 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1936  anti-sigma-factor antagonist  50.72 
 
 		 314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.729747  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1485  anti-sigma-factor antagonist  41.67 
 
 		 367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  39.11 
 
 		 372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  35.03 
 
 		 361 aa  115  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  46.83 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3857  anti-sigma-factor antagonist  48.94 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1239  anti-sigma-factor antagonist  33.98 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.974707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  42.77 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  43.94 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0621  anti-sigma-factor antagonist  27.65 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0312248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  37.13 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2715  anti-sigma-factor antagonist  50.42 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0052  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  43.75 
 
 		 509 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 		 428 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  42.76 
 
 		 549 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0092  anti-sigma-factor antagonist  40.22 
 
 		 317 aa  109  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.463616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  44.9 
 
 		 556 aa  109  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  43.61 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2210  anti-sigma-factor antagonist  38.24 
 
 		 580 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  42.24 
 
 		 388 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3476  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 380 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.837777  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  51.33 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0195  putative PAS/PAC sensor protein  46.61 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1074  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  40.41 
 
 		 433 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  37.11 
 
 		 366 aa  105  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3508  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 359 aa  105  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  42.36 
 
 		 667 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2424  anti-sigma-factor antagonist  38.6 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  38.81 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  45.69 
 
 		 283 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  45.13 
 
 		 562 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  36.91 
 
 		 290 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2503  anti-sigma-factor antagonist  41.01 
 
 		 314 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2689  anti-sigma-factor antagonist  44.2 
 
 		 314 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  37.74 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  41.67 
 
 		 421 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  39.77 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  43.18 
 
 		 568 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  37.8 
 
 		 281 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  38.51 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3133  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  42.98 
 
 		 283 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  42.42 
 
 		 559 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  38.06 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0787  anti-sigma-factor antagonist  46.34 
 
 		 317 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  41.54 
 
 		 689 aa  99.8  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4970  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  44.26 
 
 		 284 aa  99.8  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0141  anti-sigma-factor antagonist  42.96 
 
 		 298 aa  99.8  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0116373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  30.94 
 
 		 342 aa  99.8  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3137  anti-sigma-factor antagonist  44.35 
 
 		 283 aa  99.4  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  42.62 
 
 		 271 aa  99.4  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1835  anti-sigma-factor antagonist  41.13 
 
 		 331 aa  99.4  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  37.91 
 
 		 653 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  42.36 
 
 		 357 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  38.41 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1710  anti-sigma-factor antagonist  38.22 
 
 		 324 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  35.91 
 
 		 252 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  39.29 
 
 		 271 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  49.07 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 		 523 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2970  anti-sigma-factor antagonist  44.25 
 
 		 285 aa  97.8  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528649 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  38.36 
 
 		 653 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  44.86 
 
 		 286 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1671  anti-sigma-factor antagonist  44.86 
 
 		 288 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128227 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2000  anti-sigma-factor antagonist  38.36 
 
 		 321 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18395  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  40.79 
 
 		 428 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  40.29 
 
 		 510 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000586353  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  37.97 
 
 		 312 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2416  anti-sigma-factor antagonist  42.98 
 
 		 288 aa  96.7  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  36.55 
 
 		 377 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  42.86 
 
 		 285 aa  96.3  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  39.13 
 
 		 293 aa  96.3  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 		 359 aa  96.3  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  38.1 
 
 		 365 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  31.73 
 
 		 538 aa  96.3  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4858  anti-sigma-factor antagonist  41.59 
 
 		 295 aa  95.9  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  36.81 
 
 		 521 aa  95.9  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.36 
 
 		 272 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  41.03 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  36 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3768  anti-sigma-factor antagonist  42.11 
 
 		 284 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1219  positive regulator of sigma-B  42.98 
 
 		 286 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  31.05 
 
 		 359 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1492  anti-sigma-factor antagonist  38.64 
 
 		 282 aa  93.6  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3744  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 288 aa  93.2  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1316  anti-sigma-factor antagonist  34.53 
 
 		 284 aa  93.2  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 		 365 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1708  putative PAS/PAC sensor protein  30.49 
 
 		 444 aa  92.8  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  40.16 
 
 		 288 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2269  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 291 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  40.83 
 
 		 638 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  38.78 
 
 		 295 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  37.41 
 
 		 653 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  30.29 
 
 		 694 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  34.75 
 
 		 271 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4067  putative PAS/PAC sensor protein  39.67 
 
 		 429 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>