More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0112 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
119 aa  246  8e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  57.69 
 
 
121 aa  122  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  55.88 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  47.47 
 
 
116 aa  98.6  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  46.6 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  42.57 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
123 aa  90.5  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  40.57 
 
 
120 aa  90.1  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
125 aa  89  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  51.28 
 
 
95 aa  89  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
123 aa  88.6  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
127 aa  88.6  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 
116 aa  87.8  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
123 aa  87.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  48.35 
 
 
118 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  48.96 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
116 aa  84.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  45.35 
 
 
123 aa  84  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  44.55 
 
 
119 aa  84  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  40.38 
 
 
126 aa  84  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
124 aa  83.6  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  40.62 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  44.79 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  40.57 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  37.61 
 
 
336 aa  82.4  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 
137 aa  82  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  43.3 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.66 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.62 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  41 
 
 
120 aa  79.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  46.59 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  42.05 
 
 
183 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 
337 aa  78.2  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  40 
 
 
120 aa  77.4  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  42.68 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 
109 aa  77  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  51.52 
 
 
337 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  35.35 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  42.05 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  43.16 
 
 
135 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 
349 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  43 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  45.71 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  41.05 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
93 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  43.21 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  29.76 
 
 
95 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2879  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  36.71 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
115 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
108 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
119 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
114 aa  62.8  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 
97 aa  62.8  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  38.16 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  31.17 
 
 
95 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
122 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
115 aa  61.6  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 
120 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  43.08 
 
 
89 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
103 aa  61.6  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  38.96 
 
 
108 aa  61.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  30.77 
 
 
95 aa  60.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 
258 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
95 aa  60.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0208  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
95 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0315  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
103 aa  60.5  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  56 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>