120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0108 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  100 
 
 
270 aa  541  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  43.41 
 
 
264 aa  206  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  42.26 
 
 
265 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2068  membrane protein-like protein  38.17 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  32.9 
 
 
315 aa  132  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  31.74 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  30.34 
 
 
316 aa  115  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  32.92 
 
 
298 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3766  cytochrome c oxidase caa3 type assembly factor CtaG  28.32 
 
 
301 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0988  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  28.42 
 
 
300 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3987  hypothetical protein  27.87 
 
 
301 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3683  hypothetical protein  28.32 
 
 
301 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3700  CtaG membrane protein  28.32 
 
 
301 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4042  hypothetical protein  27.87 
 
 
301 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.388035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1197  hypothetical protein  27.21 
 
 
319 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3955  hypothetical protein  28.32 
 
 
301 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3852  hypothetical protein  28.21 
 
 
301 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4150  hypothetical protein  28.21 
 
 
301 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4058  hypothetical protein  28.22 
 
 
301 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  30.2 
 
 
328 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  29.96 
 
 
300 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.76 
 
 
309 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2642  cytochrome c oxidase caa3 type assembly factor CtaG  26.77 
 
 
301 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  30.8 
 
 
317 aa  99  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  28.88 
 
 
322 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  28.84 
 
 
394 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5775  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.2 
 
 
283 aa  89.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1859  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  27.1 
 
 
300 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  27.11 
 
 
300 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  28.72 
 
 
332 aa  85.5  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  30.47 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  28.81 
 
 
651 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2269  membrane protein-like protein  27.14 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761855  hitchhiker  0.00192882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  27.05 
 
 
691 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  28.57 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  28.5 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  27.02 
 
 
672 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  29.92 
 
 
678 aa  72.4  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  26.16 
 
 
736 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.64 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  26.95 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3384  hypothetical protein  29.68 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.739679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  27.95 
 
 
681 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  27.15 
 
 
687 aa  69.7  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  28.74 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  28.74 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  28.74 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  28.74 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  28.74 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  28.74 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  28.74 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.7 
 
 
319 aa  68.9  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  26.9 
 
 
752 aa  68.6  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  27.54 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  26.29 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  27.68 
 
 
718 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  25 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  25 
 
 
331 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  25 
 
 
331 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  25.97 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  26.09 
 
 
676 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  29.74 
 
 
671 aa  66.6  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  25 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  25 
 
 
308 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  24.57 
 
 
665 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  24.57 
 
 
665 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  24.57 
 
 
665 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  28.28 
 
 
664 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  30.32 
 
 
722 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0455  hypothetical protein  26.94 
 
 
274 aa  63.5  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  25.93 
 
 
328 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  28.98 
 
 
692 aa  63.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  26.22 
 
 
718 aa  62.4  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.35 
 
 
326 aa  62  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2401  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  24.46 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25.09 
 
 
307 aa  60.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1036  membrane protein  24.8 
 
 
290 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11200  membrane-like protein  31.4 
 
 
273 aa  58.9  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00435487  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  28.3 
 
 
711 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  26.77 
 
 
719 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.26 
 
 
683 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3278  membrane protein  23.55 
 
 
280 aa  58.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  26.24 
 
 
322 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  25 
 
 
679 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3846  hypothetical protein  30.3 
 
 
253 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  23.31 
 
 
651 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0159  hypothetical protein  26.89 
 
 
255 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673519  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  26.35 
 
 
708 aa  56.6  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4266  membrane protein  23.98 
 
 
289 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1130  membrane protein  23.98 
 
 
289 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0583  membrane protein  24.9 
 
 
275 aa  55.8  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.7411  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0675  membrane protein  23.98 
 
 
289 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1154  membrane protein  23.98 
 
 
289 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  25.09 
 
 
322 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5833  hypothetical protein  22.87 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  25.27 
 
 
661 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  24.14 
 
 
327 aa  53.1  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  26.29 
 
 
632 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2151  membrane protein  24.78 
 
 
289 aa  52.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240263  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.98 
 
 
675 aa  52.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>