74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0093 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
103 aa  203  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  46.08 
 
 
109 aa  90.1  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  50.52 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  41.75 
 
 
107 aa  82.4  2e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  43.88 
 
 
119 aa  80.9  6e-15  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  41.11 
 
 
108 aa  76.6  9e-14  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  38.71 
 
 
108 aa  74.3  5e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  38.71 
 
 
108 aa  74.3  5e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  40 
 
 
107 aa  67.8  5e-11  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  36.36 
 
 
107 aa  62.8  2e-09  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  35.35 
 
 
107 aa  61.2  5e-09  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3972  branched-chain amino acid transport  38.38 
 
 
108 aa  58.2  4e-08  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  35.48 
 
 
108 aa  57.8  5e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4072  integrase family protein  39.33 
 
 
109 aa  57.4  6e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  36.73 
 
 
108 aa  57.4  7e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2850  branched chain amino acid ABC transporter  39.39 
 
 
101 aa  57  8e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2540  hypothetical protein  35.8 
 
 
114 aa  56.2  1e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137358  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  33.68 
 
 
116 aa  55.1  3e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2208  branched-chain amino acid transport  32.69 
 
 
112 aa  54.7  5e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0507422  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  35.16 
 
 
109 aa  54.3  6e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  31.73 
 
 
112 aa  54.3  6e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4124  hypothetical protein  42.39 
 
 
108 aa  54.3  6e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  37.23 
 
 
108 aa  53.9  7e-07  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3607  branched-chain amino acid transport  39.18 
 
 
99 aa  53.9  7e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.459125  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1189  putative branched-chain amino acid transport protein  37.63 
 
 
106 aa  52.4  2e-06  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0971  branched-chain amino acid transport  30.77 
 
 
112 aa  52.4  2e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00496866  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0354  branched-chain amino acid transport  32.97 
 
 
109 aa  52  3e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0971347 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1047  hypothetical protein  32.69 
 
 
107 aa  51.6  4e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473278  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2458  branched-chain amino acid transport  32.29 
 
 
110 aa  51.6  4e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.478648  normal  0.376832 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  34.69 
 
 
111 aa  51.2  5e-06  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  31.73 
 
 
107 aa  50.8  6e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  35.87 
 
 
111 aa  50.8  6e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  29.35 
 
 
108 aa  50.4  7e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2937  branched-chain amino acid transport  32.35 
 
 
107 aa  50.8  7e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00590698  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  30.34 
 
 
111 aa  50.1  9e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3758  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 
114 aa  50.1  1e-05  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0829  branched-chain amino acid transport  28.26 
 
 
111 aa  49.3  2e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3875  branched-chain amino acid transport  31.11 
 
 
117 aa  48.9  2e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1478  branched-chain amino acid transport  35.23 
 
 
101 aa  48.9  2e-05  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3079  AzlD branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 
110 aa  48.9  2e-05  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.900349  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01820  branched-chain amino acid transport  34.07 
 
 
100 aa  49.3  2e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.300489  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0460  branched-chain amino acid transport  28.26 
 
 
113 aa  49.3  2e-05  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1690  hypothetical protein  31.73 
 
 
113 aa  49.3  2e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0542077  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2539  branched-chain amino acid transport  36.19 
 
 
101 aa  48.5  3e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0430  branched-chain amino acid transport  36.46 
 
 
110 aa  47.8  5e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000591514  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0159  hypothetical protein  34.38 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258263  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  34.74 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0195  branched-chain amino acid transport  32.29 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.392711 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2529  branched-chain amino acid transport  32 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2695  branched-chain amino acid transport  32 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2596  branched-chain amino acid transport  32 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4208  hypothetical protein  31.73 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000158916  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2783  branched-chain amino acid transport  32 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  0.341399 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2394  branched-chain amino acid transport  41.67 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0349  branched-chain amino acid transport  36.89 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6126  putative transmembrane protein  41.67 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.603631  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1597  branched-chain amino acid transport  32 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1560  branched-chain amino acid transport  32 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1566  branched-chain amino acid transport  32 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0616  branched-chain amino acid transport  32.69 
 
 
112 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441128  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1095  branched-chain amino acid transport  32.69 
 
 
112 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  1.16861e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1054  branched-chain amino acid transport  32.69 
 
 
112 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416307  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3400  branched-chain amino acid transport  36.54 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.737178  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4055  branched-chain amino acid transport  36.54 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.461564  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1759  hypothetical protein  32 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3294  branched-chain amino acid transport  39.22 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  35.35 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  26.14 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1458  branched-chain amino acid transport  32 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1242  branched chain amino acid ABC transporter  38.38 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0562  hypothetical protein  35.48 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  29.03 
 
 
166 aa  40.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2853  hypothetical protein  28.28 
 
 
106 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.438366  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0310  branched-chain amino acid transport  24 
 
 
102 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>