206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0090 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1146  TPR repeat-containing protein  46.9 
 
 
1091 aa  909  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000383652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2338  Tetratricopeptide TPR_4  46.34 
 
 
1089 aa  875  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.878035  normal  0.026565 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3987  TPR repeat-containing protein  47.11 
 
 
1092 aa  906  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.017736 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0090  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
1090 aa  2202  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.763002  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 
486 aa  74.3  1e-11  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.3 
 
 
1737 aa  74.3  1e-11  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.41 
 
 
988 aa  70.5  2e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.35 
 
 
1056 aa  66.2  3e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 
878 aa  65.9  4e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0258  TPR repeat-containing protein  20.71 
 
 
974 aa  65.5  6e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 
572 aa  65.1  6e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.07 
 
 
810 aa  65.1  7e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.14 
 
 
1676 aa  64.3  1e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.22 
 
 
1022 aa  62.8  3e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  20.27 
 
 
1067 aa  62.4  5e-08  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 
448 aa  61.2  1e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0696  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 
893 aa  60.8  1e-07  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  21.03 
 
 
1138 aa  60.5  2e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 
366 aa  59.7  3e-07  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  24.02 
 
 
561 aa  59.3  3e-07  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  24.02 
 
 
561 aa  59.3  4e-07  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.38 
 
 
572 aa  58.9  4e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  19.84 
 
 
543 aa  58.9  5e-07  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.68 
 
 
2240 aa  58.5  6e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.04 
 
 
1056 aa  58.5  7e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.3 
 
 
632 aa  58.2  8e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  26.52 
 
 
638 aa  57.8  1e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  20.86 
 
 
3145 aa  57.8  1e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  20.15 
 
 
927 aa  57.8  1e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.17 
 
 
882 aa  57.4  2e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  20.76 
 
 
1069 aa  57  2e-06  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 
3172 aa  57  2e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
767 aa  57  2e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  22.15 
 
 
397 aa  56.2  3e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.53 
 
 
639 aa  56.2  3e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.2774e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  19.66 
 
 
818 aa  56.6  3e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  20.75 
 
 
882 aa  56.2  4e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4380  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 
900 aa  55.5  5e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  21.46 
 
 
804 aa  55.5  5e-06  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  24.64 
 
 
936 aa  55.5  5e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  19.88 
 
 
602 aa  55.5  5e-06  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 
649 aa  55.5  5e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1722  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.38 
 
 
354 aa  55.5  6e-06  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 
265 aa  55.5  6e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.4 
 
 
1154 aa  54.3  1e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  21.61 
 
 
597 aa  54.7  1e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  21.7 
 
 
591 aa  54.3  1e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.57665e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24 
 
 
265 aa  54.3  1e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.26196e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  21.77 
 
 
4079 aa  54.3  1e-05  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  22.09 
 
 
673 aa  54.3  1e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  7.76603e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  21.66 
 
 
730 aa  53.9  1e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
4489 aa  53.1  2e-05  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  23.92 
 
 
955 aa  53.1  2e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.02 
 
 
884 aa  53.9  2e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.14 
 
 
624 aa  53.9  2e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  20.59 
 
 
634 aa  53.5  2e-05  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  19.91 
 
 
887 aa  53.1  2e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  19.75 
 
 
732 aa  53.9  2e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 
909 aa  53.5  2e-05  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  21.76 
 
 
1276 aa  53.5  2e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  21.03 
 
 
1297 aa  53.1  3e-05  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  19.14 
 
 
1056 aa  52.8  3e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 
693 aa  53.1  3e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  21.99 
 
 
3035 aa  52.8  3e-05  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  23.41 
 
 
1073 aa  53.1  3e-05  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  20.28 
 
 
1252 aa  53.1  3e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2761  TPR repeat-containing protein  22.48 
 
 
468 aa  52.4  4e-05  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.594013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  27.86 
 
 
583 aa  52.8  4e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.41 
 
 
725 aa  52.4  4e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  21.97 
 
 
566 aa  52.4  5e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
3301 aa  52.4  5e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  21.21 
 
 
594 aa  52.4  5e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.9 
 
 
1000 aa  52  6e-05  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 
722 aa  52  6e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  19.91 
 
 
784 aa  52  7e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 
450 aa  51.6  9e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1260  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
616 aa  51.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.126899  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  28 
 
 
648 aa  51.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  21.22 
 
 
685 aa  50.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  20.92 
 
 
594 aa  51.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 
643 aa  51.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.74385e-07  hitchhiker  4.66075e-06 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 
632 aa  51.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  7.34837e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 
1827 aa  50.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  19.93 
 
 
1252 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
2262 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  36.56 
 
 
776 aa  50.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  36.56 
 
 
821 aa  50.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  36.56 
 
 
776 aa  50.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  20.6 
 
 
245 aa  50.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 
520 aa  50.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  26.62 
 
 
648 aa  50.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
1061 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0685  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.75 
 
 
883 aa  50.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  36.56 
 
 
776 aa  50.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  36.56 
 
 
821 aa  50.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  22.84 
 
 
992 aa  50.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 
776 aa  50.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 
776 aa  50.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  18.67 
 
 
681 aa  49.7  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  19.6 
 
 
409 aa  49.7  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>