40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0080 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0080  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
379 aa  774  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0434  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 
382 aa  186  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0175  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 
378 aa  154  3e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.122625  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2055  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 
341 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0154503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1341  polysaccharide deacetylase  29.19 
 
 
379 aa  148  2e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000820876  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1476  polysaccharide deacetylase  29.77 
 
 
353 aa  147  4e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.412903  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2967  hypothetical protein  30.33 
 
 
363 aa  137  3e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2851  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 
371 aa  133  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  2.58612e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24520  predicted xylanase/chitin deacetylase  33.69 
 
 
292 aa  132  1e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.417407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0063  hypothetical protein  30.45 
 
 
363 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3510  polysaccharide deacetylase  31.18 
 
 
348 aa  122  1e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  27.39 
 
 
282 aa  66.6  6e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 
251 aa  62  2e-08  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  30.73 
 
 
274 aa  58.9  2e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  24.69 
 
 
319 aa  53.9  4e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.57717e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  28.82 
 
 
306 aa  53.5  7e-06  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  28.82 
 
 
306 aa  52.8  9e-06  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  22.98 
 
 
274 aa  51.2  3e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  23.64 
 
 
271 aa  50.4  5e-05  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  25.4 
 
 
278 aa  50.4  6e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  23.05 
 
 
291 aa  49.7  8e-05  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 
244 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  26.63 
 
 
258 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  28.21 
 
 
233 aa  48.5  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  25.45 
 
 
234 aa  48.5  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  25.26 
 
 
275 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  28.21 
 
 
233 aa  48.1  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  26.23 
 
 
233 aa  47.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 
598 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1454  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
201 aa  47  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0891104  hitchhiker  6.78514e-05 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  26.46 
 
 
270 aa  46.6  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  23.33 
 
 
615 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  23.33 
 
 
615 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  28.99 
 
 
510 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 
321 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  30.13 
 
 
624 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  21.05 
 
 
645 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0171  polysaccharide deacetylase  22.71 
 
 
259 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0521886  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  24.05 
 
 
256 aa  43.1  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  33.06 
 
 
347 aa  42.7  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  5.2436e-06  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>