More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0063 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  60.15 
 
 
653 aa  786  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  55.92 
 
 
665 aa  716  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  4.26335e-05 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 
641 aa  1326  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  54.55 
 
 
669 aa  706  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  48.24 
 
 
624 aa  591  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  46.63 
 
 
625 aa  556  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  45.79 
 
 
607 aa  555  1e-157  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  45.63 
 
 
607 aa  551  1e-155  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  45.48 
 
 
607 aa  545  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  45.99 
 
 
588 aa  539  1e-152  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  43.47 
 
 
607 aa  541  1e-152  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  42.97 
 
 
620 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  45.92 
 
 
613 aa  520  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  44.09 
 
 
613 aa  519  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  43.13 
 
 
620 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  43.68 
 
 
615 aa  514  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  43.27 
 
 
614 aa  501  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  42.47 
 
 
628 aa  488  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  4.67295e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  43.96 
 
 
622 aa  484  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  40.71 
 
 
613 aa  483  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  40.19 
 
 
601 aa  483  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  41.07 
 
 
685 aa  475  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  42.93 
 
 
616 aa  477  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  40.99 
 
 
593 aa  467  1e-130  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  40.67 
 
 
594 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  40.67 
 
 
594 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  40.67 
 
 
594 aa  463  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  40.67 
 
 
594 aa  463  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  40.67 
 
 
594 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  39.01 
 
 
649 aa  461  1e-128  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  40.86 
 
 
594 aa  461  1e-128  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  40.68 
 
 
604 aa  459  1e-128  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  40.41 
 
 
594 aa  460  1e-128  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  40.51 
 
 
594 aa  458  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  40.37 
 
 
678 aa  459  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  40.35 
 
 
594 aa  457  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  40.51 
 
 
611 aa  454  1e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  40.51 
 
 
594 aa  454  1e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  41.05 
 
 
591 aa  454  1e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 
596 aa  450  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  38.94 
 
 
617 aa  445  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  1.1349e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  41.05 
 
 
590 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  41.71 
 
 
617 aa  444  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  39.59 
 
 
678 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  37.88 
 
 
671 aa  444  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  40.9 
 
 
607 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  38.02 
 
 
708 aa  439  1e-122  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  39.94 
 
 
676 aa  440  1e-122  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  38.65 
 
 
658 aa  439  1e-122  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  39.94 
 
 
676 aa  440  1e-122  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  39.94 
 
 
676 aa  440  1e-122  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  38.9 
 
 
656 aa  438  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  40.86 
 
 
614 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  39.68 
 
 
641 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  41 
 
 
604 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  40.73 
 
 
610 aa  436  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  39.84 
 
 
666 aa  438  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  37.7 
 
 
612 aa  435  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.4331e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  41.27 
 
 
613 aa  433  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  40.13 
 
 
631 aa  431  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  39.75 
 
 
616 aa  429  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  40.48 
 
 
609 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  39.3 
 
 
626 aa  431  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  37.73 
 
 
665 aa  430  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  39.71 
 
 
591 aa  429  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  40.31 
 
 
624 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  38.75 
 
 
679 aa  431  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  3.92618e-06 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13070  Excinuclease ABC subunit C  39.84 
 
 
651 aa  430  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  38.62 
 
 
619 aa  431  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  38.09 
 
 
646 aa  429  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  37.36 
 
 
660 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  39.31 
 
 
638 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  40.47 
 
 
615 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  37.72 
 
 
599 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  36.57 
 
 
677 aa  422  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1060  excinuclease ABC subunit C  38.84 
 
 
658 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41739  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  39.4 
 
 
623 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3146  excinuclease ABC subunit C  38.78 
 
 
690 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.055346  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  38.54 
 
 
610 aa  424  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  39.19 
 
 
599 aa  424  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  38.61 
 
 
594 aa  424  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  38.43 
 
 
692 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  38.71 
 
 
627 aa  423  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  38.92 
 
 
623 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  38.59 
 
 
631 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  39.78 
 
 
623 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  36.9 
 
 
675 aa  421  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  37.65 
 
 
693 aa  422  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  38.25 
 
 
636 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  39.07 
 
 
613 aa  420  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  38.92 
 
 
623 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2220  excinuclease ABC subunit C  39.2 
 
 
639 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0021269  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  39.87 
 
 
629 aa  418  1e-115  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  38.81 
 
 
617 aa  416  1e-115  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  37.42 
 
 
612 aa  416  1e-115  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  38.38 
 
 
690 aa  418  1e-115  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2312  excinuclease ABC subunit C  40.41 
 
 
623 aa  419  1e-115  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.136814 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  37.74 
 
 
593 aa  416  1e-115  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  37.29 
 
 
649 aa  419  1e-115  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  37.21 
 
 
643 aa  418  1e-115  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>