31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0056 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0056  PGAP1 family protein  100 
 
 
387 aa  788  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3545  PGAP1-like  45.27 
 
 
423 aa  304  2e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3594  PGAP1 family protein  41.45 
 
 
449 aa  290  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1023  PGAP1 family protein  40.66 
 
 
399 aa  288  9e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0358046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0964  PGAP1-like  40.66 
 
 
414 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1026  PGAP1 family protein  39.64 
 
 
399 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4373  PGAP1-like  43.14 
 
 
374 aa  266  5e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3190  PGAP1 family protein  41.07 
 
 
396 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0301  hypothetical protein  32.75 
 
 
488 aa  206  5e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0332  PGAP1-like  32.75 
 
 
487 aa  206  5e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0514  PGAP1 family protein  31.68 
 
 
474 aa  196  7e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.513101 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1215  PGAP1 family protein  30.69 
 
 
413 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.765286  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1198  PGAP1-like protein  30.69 
 
 
413 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2070  PGAP1 family protein  29.44 
 
 
495 aa  168  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0300  PGAP1 family protein  29.56 
 
 
407 aa  166  7e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76857  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2983  PGAP1 family protein  34.37 
 
 
437 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2497  PGAP1 family protein  30.7 
 
 
418 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3479  PGAP1 family protein  31.39 
 
 
378 aa  134  2e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3693  hypothetical protein  32.81 
 
 
304 aa  130  4e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.475055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  23.53 
 
 
382 aa  52.4  2e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  32 
 
 
211 aa  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  31.65 
 
 
191 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2153  hypothetical protein  28.3 
 
 
533 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2003  hypothetical protein  28.3 
 
 
533 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0101  hypothetical protein  30.77 
 
 
1937 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.485173 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2300  hypothetical protein  27.36 
 
 
533 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.140059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2184  hypothetical protein  27.36 
 
 
533 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  33.08 
 
 
324 aa  43.1  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1955  hypothetical protein  27.36 
 
 
533 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2219  hypothetical protein  27.36 
 
 
533 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311765  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2600  PGAP1 family protein  43.4 
 
 
589 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>