More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0053 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0053  aminotransferase class I and II  100 
 
 
366 aa  740    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2419  aminotransferase  31.1 
 
 
396 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181004  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1475  aminotransferase  29.71 
 
 
363 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0118  putative aminotransferase  29.9 
 
 
384 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0133  putative aminotransferase  30.41 
 
 
384 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0119  putative aminotransferase  30.41 
 
 
384 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.234511  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2971  putative aminotransferase  30.49 
 
 
384 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3032  putative aminotransferase  30.49 
 
 
384 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0157  putative aminotransferase  30.49 
 
 
384 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3339  putative aminotransferase  30.49 
 
 
384 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1570  putative aminotransferase  30.49 
 
 
384 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2936  putative aminotransferase  29.9 
 
 
384 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4026  putative aminotransferase  30.49 
 
 
384 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3953  putative aminotransferase  30.49 
 
 
384 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880555  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  25.15 
 
 
367 aa  94.4  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3299  putative aminotransferase  29.38 
 
 
384 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0119  putative aminotransferase  30.2 
 
 
384 aa  92.8  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4435  putative aminotransferase  29.89 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  28.92 
 
 
383 aa  92.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  25.55 
 
 
394 aa  92.4  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  28.92 
 
 
383 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3295  putative aminotransferase  31.07 
 
 
384 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2403  putative aminotransferase  26.72 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.121886  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0109  putative aminotransferase  29.15 
 
 
384 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  26.9 
 
 
386 aa  90.5  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  24.68 
 
 
397 aa  90.5  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  23.81 
 
 
386 aa  90.1  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  27.35 
 
 
389 aa  90.1  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  25 
 
 
373 aa  89  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  31.65 
 
 
396 aa  89  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0031  putative aminotransferase  26.87 
 
 
384 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  26.7 
 
 
400 aa  87.8  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  21.93 
 
 
374 aa  87.4  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  26.91 
 
 
391 aa  87  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  28.69 
 
 
382 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0014  putative aminotransferase  28.65 
 
 
384 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  25.39 
 
 
392 aa  85.9  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  28.38 
 
 
382 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  28.57 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  23.53 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  25.39 
 
 
392 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1160  aminotransferase  25.89 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.366108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  27.41 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  25.53 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  23.77 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  28.51 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  23.75 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  23.26 
 
 
388 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1369  putative aminotransferase  27.01 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  29.97 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  29.77 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2600  aminotransferase class I and II  31.45 
 
 
396 aa  83.2  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.492563 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  24.66 
 
 
399 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  26.64 
 
 
389 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0911  aminotransferase, class I and II  26.56 
 
 
367 aa  82.8  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  28.24 
 
 
383 aa  82.4  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1450  putative aminotransferase  28.82 
 
 
391 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  24.86 
 
 
397 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  26.75 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  29.74 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5709  aspartate transaminase  30.08 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  27.85 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  26.13 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  26.84 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  25.42 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  30.85 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  23.88 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2490  putative aminotransferase  26.73 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.228647  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  29.02 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  27.87 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  23.87 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  26.51 
 
 
369 aa  79.7  0.00000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  25.32 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  23.39 
 
 
372 aa  79.3  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  26.84 
 
 
356 aa  79  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  25.1 
 
 
382 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  23.85 
 
 
390 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  21.57 
 
 
391 aa  79  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  25.61 
 
 
396 aa  79  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  26.84 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  24.58 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65770  aspartate transaminase  29.66 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0893618  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0627  aminotransferase class I and II  24.55 
 
 
369 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  30.94 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  25.42 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  25 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  24.24 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  24.58 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  23.14 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  26.64 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  25.08 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  22.9 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  26.64 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  30.04 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4927  putative aminotransferase  24.84 
 
 
393 aa  77  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  26.21 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1373  putative aminotransferase  25.95 
 
 
390 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  26.1 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  27.31 
 
 
391 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  29.17 
 
 
397 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.069515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>