153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0052 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0052  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
350 aa  697  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  38.58 
 
 
521 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  26.41 
 
 
388 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3649  anti-sigma-factor antagonist  42.06 
 
 
361 aa  89.7  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4422  putative PAS/PAC sensor protein  28.97 
 
 
492 aa  89.7  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0092  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.463616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  32.7 
 
 
361 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  37.98 
 
 
523 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2000  anti-sigma-factor antagonist  29.33 
 
 
321 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18395  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0621  anti-sigma-factor antagonist  33.78 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0312248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2424  anti-sigma-factor antagonist  33.76 
 
 
317 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2646  anti-sigma-factor antagonist  34.23 
 
 
261 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  36.3 
 
 
385 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3278  anti-sigma-factor antagonist  29.8 
 
 
318 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  36.81 
 
 
372 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 
357 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3857  anti-sigma-factor antagonist  32.93 
 
 
316 aa  85.9  1e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3508  anti-sigma-factor antagonist  31.13 
 
 
359 aa  85.5  1e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  32.74 
 
 
366 aa  85.5  1e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2210  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 
580 aa  85.5  1e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  35.57 
 
 
359 aa  85.5  1e-15  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  3.62321e-07  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0577  anti-sigma-factor antagonist  36.59 
 
 
385 aa  84.7  2e-15  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  29.19 
 
 
365 aa  84.7  2e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2503  anti-sigma-factor antagonist  36.28 
 
 
314 aa  84.3  3e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.244324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2689  anti-sigma-factor antagonist  36.84 
 
 
314 aa  84.3  3e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  26.21 
 
 
359 aa  84  3e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  26.58 
 
 
362 aa  84  4e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  39.55 
 
 
357 aa  83.2  6e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3442  anti-sigma-factor antagonist  31.63 
 
 
342 aa  82.4  1e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  36.43 
 
 
638 aa  82  1e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1710  anti-sigma-factor antagonist  28.81 
 
 
324 aa  82  1e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  30.46 
 
 
371 aa  82  1e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4192  anti-sigma-factor antagonist  27.91 
 
 
380 aa  81.6  2e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  27.95 
 
 
361 aa  80.9  3e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1835  anti-sigma-factor antagonist  35.65 
 
 
331 aa  80.5  4e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  28.94 
 
 
549 aa  80.1  6e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0787  anti-sigma-factor antagonist  29.2 
 
 
317 aa  79.3  9e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.135868 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1936  anti-sigma-factor antagonist  37.01 
 
 
314 aa  79  1e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.729747  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  35.19 
 
 
430 aa  79.3  1e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2715  anti-sigma-factor antagonist  38.53 
 
 
341 aa  79.3  1e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  43.14 
 
 
421 aa  77.8  2e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1393  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 
384 aa  77.4  4e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.632841  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  37.88 
 
 
428 aa  77  5e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  35.61 
 
 
439 aa  76.6  7e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1239  anti-sigma-factor antagonist  31.61 
 
 
314 aa  76.3  7e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.974707  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0268  anti-sigma-factor antagonist  31.06 
 
 
363 aa  75.5  1e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0598617 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 
445 aa  75.5  1e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  34.96 
 
 
689 aa  74.7  2e-12  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0868  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 
506 aa  74.7  2e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  35.09 
 
 
275 aa  74.7  2e-12  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  27.95 
 
 
365 aa  74.3  3e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  36.97 
 
 
653 aa  73.9  4e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  29.21 
 
 
377 aa  73.2  6e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6567  anti-sigma-factor antagonist  39.45 
 
 
286 aa  73.2  7e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967653  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1708  putative PAS/PAC sensor protein  29.01 
 
 
444 aa  72.4  1e-11  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  37.7 
 
 
295 aa  72.4  1e-11  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  2.4656e-06 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
559 aa  72.4  1e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  32.5 
 
 
231 aa  71.6  2e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1485  anti-sigma-factor antagonist  24.61 
 
 
367 aa  71.6  2e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3473  anti-sigma-factor antagonist  32.06 
 
 
422 aa  71.6  2e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.551903  normal  0.0822697 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4490  anti-sigma-factor antagonist  31.54 
 
 
511 aa  70.9  3e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  decreased coverage  0.000741245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3688  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 
350 aa  70.9  4e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109455  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  35.66 
 
 
509 aa  70.5  4e-11  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1098  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 
514 aa  70.1  6e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 
568 aa  69.7  7e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  30.97 
 
 
357 aa  69.7  8e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2986  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
341 aa  68.6  1e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 
370 aa  68.6  2e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  31.9 
 
 
365 aa  68.6  2e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  36.59 
 
 
312 aa  68.6  2e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  31.16 
 
 
510 aa  68.6  2e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  5.86353e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2635  anti-sigma-factor antagonist  34.91 
 
 
355 aa  68.2  2e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4191  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 
372 aa  68.2  2e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  34.92 
 
 
556 aa  67.8  3e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0413  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 
388 aa  67.4  3e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  35.43 
 
 
538 aa  67  4e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  44.33 
 
 
323 aa  67.4  4e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  36.89 
 
 
655 aa  67.4  4e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.29 
 
 
272 aa  66.6  5e-10  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  6.03056e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  36.04 
 
 
653 aa  67  5e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 
562 aa  67  5e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1037  putative PAS/PAC sensor protein  29.46 
 
 
484 aa  67  5e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3609  anti-sigma-factor antagonist  26.58 
 
 
411 aa  66.6  6e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.196503  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  29.93 
 
 
299 aa  66.6  6e-10  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  30.97 
 
 
388 aa  66.6  6e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4067  putative PAS/PAC sensor protein  39.17 
 
 
429 aa  66.2  7e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  24.05 
 
 
342 aa  66.2  7e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 
359 aa  65.9  9e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  34.91 
 
 
433 aa  66.2  9e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  37.1 
 
 
428 aa  65.5  1e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4698  anti-sigma-factor antagonist  28.19 
 
 
363 aa  65.9  1e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0409  putative PAS/PAC sensor protein  30.08 
 
 
492 aa  65.1  2e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  32.46 
 
 
283 aa  65.1  2e-09  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  32.79 
 
 
358 aa  64.7  2e-09  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  35.29 
 
 
667 aa  65.1  2e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3859  anti-sigma-factor antagonist  32.77 
 
 
295 aa  65.1  2e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  32.52 
 
 
286 aa  65.1  2e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  26.37 
 
 
325 aa  64.7  2e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1894  anti-sigma-factor antagonist  29.5 
 
 
344 aa  64.3  3e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  31.43 
 
 
315 aa  64.3  3e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>