More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0049 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
252 aa  512  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.62 
 
 
224 aa  132  4e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.87 
 
 
225 aa  129  4e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
222 aa  125  4e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  34.98 
 
 
225 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  36.24 
 
 
222 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  35.94 
 
 
224 aa  121  1e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.84 
 
 
223 aa  120  2e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  34.63 
 
 
226 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
225 aa  119  4e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.39 
 
 
225 aa  119  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
224 aa  118  1e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  32.74 
 
 
228 aa  117  1e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
224 aa  118  1e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
224 aa  118  1e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.72 
 
 
224 aa  117  2e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  33.02 
 
 
220 aa  117  2e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  35.94 
 
 
224 aa  117  2e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.02 
 
 
224 aa  117  2e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
224 aa  117  2e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
229 aa  116  4e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
224 aa  115  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
224 aa  115  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.63 
 
 
228 aa  115  7e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  37.5 
 
 
225 aa  114  1e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.48 
 
 
224 aa  114  1e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.17 
 
 
242 aa  114  1e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  33.64 
 
 
225 aa  114  2e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.64 
 
 
226 aa  114  2e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.3 
 
 
228 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.38 
 
 
251 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.98 
 
 
219 aa  112  4e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.07267e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  35.27 
 
 
214 aa  112  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
241 aa  110  1e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.94 
 
 
225 aa  110  2e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
225 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  9.29699e-05 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
225 aa  109  4e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  36.41 
 
 
225 aa  109  4e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.86 
 
 
225 aa  108  7e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  34.72 
 
 
226 aa  108  8e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  28.05 
 
 
243 aa  108  8e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  31.42 
 
 
225 aa  107  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  30.94 
 
 
224 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.74 
 
 
225 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.44 
 
 
226 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.38 
 
 
225 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.63 
 
 
224 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
230 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.64 
 
 
224 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
246 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  29.77 
 
 
239 aa  103  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.61 
 
 
220 aa  102  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  1.48221e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
230 aa  102  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.4 
 
 
225 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.16 
 
 
226 aa  101  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
227 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  31 
 
 
247 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  28.1 
 
 
236 aa  99  6e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.44 
 
 
225 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
246 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
226 aa  95.5  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
223 aa  95.1  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
232 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.12 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  34.12 
 
 
217 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
225 aa  95.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.57 
 
 
243 aa  93.6  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.33 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  30.88 
 
 
223 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
219 aa  93.6  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
226 aa  93.2  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4577  cAMP-regulatory protein  32.07 
 
 
214 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5111  cAMP-regulatory protein  33.15 
 
 
214 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
226 aa  92  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  34.68 
 
 
215 aa  92  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3198  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.69 
 
 
221 aa  92  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.90573 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.1 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.36 
 
 
235 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.8 
 
 
232 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.48 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  8.36213e-06 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  32.04 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  34.1 
 
 
214 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  31 
 
 
249 aa  89.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
227 aa  89.7  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.86 
 
 
228 aa  89.4  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1063  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.05 
 
 
238 aa  89.4  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
254 aa  89  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2797  cAMP-regulatory protein  32 
 
 
198 aa  89  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  29 
 
 
234 aa  88.6  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0596  catabolite gene activator Crp  31.52 
 
 
214 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.13 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4779  cAMP-regulatory protein  30.65 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.45 
 
 
226 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2514  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
231 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0629  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.24 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  2.85446e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>