More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0033 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0033  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
302 aa  612  1e-174  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000417374  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3534  LysR substrate-binding protein  38.01 
 
 
292 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
296 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1650  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
301 aa  174  2e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1664  LysR substrate-binding protein  36.73 
 
 
288 aa  172  8e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2213  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  35.97 
 
 
297 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03795  hypothetical protein  37.55 
 
 
305 aa  164  2e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4195  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  37.55 
 
 
305 aa  164  2e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4503  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  37.55 
 
 
305 aa  164  2e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.030834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4055  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  37.55 
 
 
305 aa  164  2e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4409  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  37.55 
 
 
305 aa  164  2e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386018  normal  0.0576457 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4025  transcriptional regulator, LysR family  37.55 
 
 
305 aa  164  2e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5423  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  37.55 
 
 
305 aa  164  2e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.748146 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03846  DNA-binding transcriptional dual regulator  37.55 
 
 
305 aa  164  2e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782076  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4448  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  37.55 
 
 
305 aa  164  2e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4453  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  36.3 
 
 
305 aa  162  5e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  hitchhiker  7.41656e-05 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4456  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  36.3 
 
 
305 aa  162  5e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.10908e-06 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4335  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  36.3 
 
 
305 aa  162  5e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4366  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  36.3 
 
 
305 aa  162  5e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4530  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  36.3 
 
 
305 aa  162  5e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  hitchhiker  3.32798e-06 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3788  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  37.28 
 
 
302 aa  162  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4025  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  36.82 
 
 
305 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0193  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  36.46 
 
 
302 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03200  transcriptional regulator  35.52 
 
 
300 aa  159  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00035  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  35.97 
 
 
302 aa  159  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0187  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  36.46 
 
 
302 aa  159  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0127  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  36.46 
 
 
305 aa  158  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.985261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4775  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  36.1 
 
 
305 aa  156  5e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760624  hitchhiker  0.00336049 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002320  Transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 
303 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.726256  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3406  transcriptional regulator, LysR family  35.09 
 
 
336 aa  153  3e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0119  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  35.97 
 
 
305 aa  152  9e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.985596  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0138  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  35.97 
 
 
305 aa  152  9e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4079  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  35.97 
 
 
305 aa  152  9e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3535  transcriptional regulator, LysR family  34.74 
 
 
323 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300958  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3211  LysR substrate-binding  35.09 
 
 
323 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.847319  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4222  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
302 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79182  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  36.13 
 
 
292 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3286  LysR family transcriptional regulator  36.2 
 
 
313 aa  147  1e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.254644  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0653  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
314 aa  147  2e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105703  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4389  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
301 aa  146  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0036  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  31.77 
 
 
304 aa  145  6e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2340  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 
313 aa  145  6e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0639  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
319 aa  145  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2714  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  31.79 
 
 
302 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5250  transcriptional regulator, LysR family  35.82 
 
 
313 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2432  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 
320 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0631  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
311 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.808562  normal  0.903361 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  31.65 
 
 
296 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1654  hydrogen peroxide-inducible genes activator  33.21 
 
 
311 aa  143  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00724333  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0687  transcriptional regulator, LysR family  35.64 
 
 
320 aa  143  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.366193 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0520  hydrogen peroxide-inducible genes activator  33.21 
 
 
311 aa  143  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.454545  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  33.33 
 
 
296 aa  143  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0434  transcriptional regulator, LysR family  31.34 
 
 
312 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351851  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0020  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 
330 aa  143  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3244  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 
306 aa  142  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
300 aa  141  1e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4718  hydrogen peroxide-inducible genes activator  32.55 
 
 
299 aa  141  1e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0323  transcriptional regulator, LysR family  32.32 
 
 
323 aa  141  2e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.712215  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0871  oxidative stress transcriptional regulator  33.33 
 
 
311 aa  140  2e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  1.80312e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4681  transcriptional regulator, LysR family  32.01 
 
 
304 aa  141  2e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.468795  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0334  transcriptional regulator, LysR family  32.32 
 
 
323 aa  140  2e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.937617  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3739  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 
307 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.717698  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0783  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
311 aa  140  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33611  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2958  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 
324 aa  140  4e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3802  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
309 aa  139  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.238076  normal  0.337014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 
343 aa  139  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04591  oxidative stress transcriptional regulator  34.53 
 
 
313 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
323 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2323  oxidative stress transcriptional regulator  31.91 
 
 
301 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523521  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4725  transcriptional regulator, LysR family  33.81 
 
 
304 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255479  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0678  transcriptional regulator, LysR family  32.52 
 
 
309 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  34.41 
 
 
301 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  3.15182e-05  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0054  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
304 aa  137  3e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2522  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
319 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0196222  normal  0.718346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2941  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
318 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
316 aa  136  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2782  LysR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
301 aa  136  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1535  DNA-binding transcriptional regulator CynR  34.94 
 
 
300 aa  135  6e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.195582  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 
303 aa  135  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0036  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 
301 aa  135  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0711  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 
319 aa  134  1e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
289 aa  134  2e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3987  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
319 aa  134  2e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3497  transcriptional regulator, substrate-binding, LysR family protein  34.2 
 
 
301 aa  134  2e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.794623  hitchhiker  3.80526e-05 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5066  transcriptional regulator, LysR family  31.76 
 
 
321 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0724  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 
327 aa  133  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 
299 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2805  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
316 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0202  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.62 
 
 
307 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0312  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
323 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1168  oxidative stress regulatory protein OxyR  30.42 
 
 
319 aa  132  8e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2576  oxidative stress regulatory protein OxyR  30.42 
 
 
319 aa  132  8e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0307  oxidative stress regulatory protein OxyR  30.42 
 
 
319 aa  132  8e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
296 aa  132  8e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2390  oxidative stress regulatory protein OxyR  30.42 
 
 
319 aa  132  8e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 
310 aa  132  8e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1281  oxidative stress regulatory protein OxyR  30.42 
 
 
319 aa  131  1e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1013  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
321 aa  132  1e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0736859  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1615  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
311 aa  131  1e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0196883 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0103  transcriptional regulator, LysR family  31.19 
 
 
318 aa  131  1e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>