More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0032 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1242  Catalase  64.02 
 
 
480 aa  654    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122794 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1421  catalase  68.15 
 
 
488 aa  667    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.898508  normal  0.0406547 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2855  catalase  62.42 
 
 
479 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  64.92 
 
 
479 aa  665    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2441  catalase  62.08 
 
 
481 aa  643    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431026  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0355  catalase  68.06 
 
 
499 aa  679    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.692778  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2521  catalase  64.14 
 
 
484 aa  649    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.723936 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  100 
 
 
485 aa  1015    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1574  hypothetical protein  61.24 
 
 
501 aa  634    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0310454 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0712  Catalase  64.63 
 
 
484 aa  655    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5844  Catalase  63.27 
 
 
493 aa  653    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453783  normal  0.956183 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1759  Catalase  64.19 
 
 
483 aa  644    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191846  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0656  catalase  64.92 
 
 
506 aa  645    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2779  Catalase  66.39 
 
 
498 aa  652    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  65.06 
 
 
481 aa  675    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2465  Catalase  71.97 
 
 
485 aa  723    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.864013 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0322  catalase  68.27 
 
 
499 aa  683    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2262  catalase-like  64.12 
 
 
477 aa  656    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4268  catalase  65.33 
 
 
483 aa  657    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338278  normal  0.901094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  63.43 
 
 
484 aa  669    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2779  catalase  68.15 
 
 
488 aa  667    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05192  catalase  62.32 
 
 
478 aa  647    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2321  catalase  71.19 
 
 
501 aa  697    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0215  catalase  63.1 
 
 
483 aa  648    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1323  catalase  63.88 
 
 
478 aa  650    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2489  catalase  69.83 
 
 
484 aa  689    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.350666  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3278  catalase  63.35 
 
 
478 aa  652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3054  catalase  67.43 
 
 
499 aa  672    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0830  catalase  73.46 
 
 
480 aa  726    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5439  Catalase  68.07 
 
 
485 aa  671    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0269  catalase  66.88 
 
 
504 aa  659    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146052  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3986  catalase  64.3 
 
 
484 aa  653    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0864  catalase  65.49 
 
 
482 aa  670    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0518  Catalase  61.13 
 
 
483 aa  635    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.309279  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2776  catalase  62.42 
 
 
479 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1999  catalase  65.9 
 
 
514 aa  649    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.209766  normal  0.601662 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5599  catalase  63.16 
 
 
481 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.555062  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1494  Catalase  63.98 
 
 
485 aa  650    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0618429  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1165  Catalase  64.54 
 
 
547 aa  635    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1801  Catalase  63.6 
 
 
496 aa  647    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4722  catalase  64.08 
 
 
479 aa  658    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001311  catalase  62.53 
 
 
479 aa  648    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09150  catalase  65.7 
 
 
482 aa  671    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.789625 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  64.71 
 
 
479 aa  663    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1320  catalase  62.42 
 
 
479 aa  647    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2706  Catalase  65.48 
 
 
499 aa  651    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21110  catalase  67.73 
 
 
487 aa  671    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.218837 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1721  catalase  63.43 
 
 
487 aa  660    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1932  catalase  63.22 
 
 
488 aa  660    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3018  catalase  64.85 
 
 
485 aa  659    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  64.92 
 
 
479 aa  663    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4001  catalase  64.54 
 
 
487 aa  651    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1958  catalase  63.98 
 
 
483 aa  643    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2662  catalase  65.73 
 
 
486 aa  647    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0383  catalase  64.51 
 
 
494 aa  634  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0289  catalase  61.89 
 
 
490 aa  628  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.745578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0333  Catalase  61.89 
 
 
490 aa  628  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0365  Catalase  61.27 
 
 
490 aa  630  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357048  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3881  catalase  59.71 
 
 
480 aa  625  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000327701  hitchhiker  0.000000338063 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1576  catalase  65.12 
 
 
474 aa  619  1e-176  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.278462  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0265  catalase  65.33 
 
 
474 aa  620  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1387  catalase  65.12 
 
 
474 aa  619  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000679986  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1057  catalase  63.79 
 
 
480 aa  617  1e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.852537  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0273  catalase  63.37 
 
 
474 aa  608  1e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1422  catalase  59.22 
 
 
505 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000148509  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4417  Catalase  60.46 
 
 
490 aa  607  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0279064  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1395  catalase  59.22 
 
 
505 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000176487  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0903  catalase  59.27 
 
 
504 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5463  Catalase  58.69 
 
 
481 aa  602  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0128  Catalase  59.38 
 
 
517 aa  601  1.0000000000000001e-171  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3190  catalase  59.13 
 
 
486 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0631825  normal  0.81248 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1070  catalase  58.76 
 
 
486 aa  598  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3029  catalase  58.76 
 
 
486 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0945  catalase  58.76 
 
 
486 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0885996  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3940  catalase  58.9 
 
 
493 aa  597  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.109711  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0908  catalase domain-containing protein  58.56 
 
 
486 aa  598  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161902  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2941  catalase  58.97 
 
 
488 aa  597  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1147  catalase  60.68 
 
 
479 aa  592  1e-168  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11065  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0563  catalase  57.41 
 
 
486 aa  592  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0638  catalase  57.2 
 
 
487 aa  589  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3392  Catalase  56.91 
 
 
491 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3591  catalase  57.32 
 
 
491 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0894  catalase  57.32 
 
 
491 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3468  catalase  57.32 
 
 
491 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.482946  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  56.7 
 
 
504 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  57.08 
 
 
505 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0481  catalase  56.28 
 
 
498 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0778  Catalase  55.3 
 
 
507 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0546  Catalase  55.88 
 
 
574 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0342  Catalase  61.87 
 
 
556 aa  525  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0517  Catalase  53.78 
 
 
483 aa  522  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1649  catalase  55.91 
 
 
555 aa  522  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0672008  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1622  Catalase  55.01 
 
 
500 aa  523  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468937  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2782  Catalase  55.77 
 
 
494 aa  519  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00522  catalase  52.92 
 
 
491 aa  521  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20430  catalase  55.97 
 
 
499 aa  520  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.678559  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3637  Catalase  53.64 
 
 
493 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155654  decreased coverage  0.00459164 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0236  catalase  53.1 
 
 
482 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0803  catalase  53.25 
 
 
487 aa  512  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1236  Catalase  54.32 
 
 
483 aa  512  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0619868  normal  0.69126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>