248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0020 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0020  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  100 
 
 
68 aa  137  5e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0889  exodeoxyribonuclease VII small subunit  59.62 
 
 
80 aa  60.8  6e-09  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.48 
 
 
83 aa  60.5  7e-09  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.62 
 
 
86 aa  60.5  8e-09  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.48 
 
 
83 aa  60.1  9e-09  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4304  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.03 
 
 
83 aa  60.1  9e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185821  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0542  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.79 
 
 
84 aa  60.1  1e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0431  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.79 
 
 
84 aa  60.1  1e-08  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0438  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.79 
 
 
84 aa  60.1  1e-08  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.55 
 
 
94 aa  58.9  2e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  51.72 
 
 
87 aa  59.3  2e-08  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  6.91643e-05 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.69 
 
 
80 aa  58.5  3e-08  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.69 
 
 
80 aa  58.5  3e-08  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.69 
 
 
80 aa  58.5  3e-08  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  57.69 
 
 
80 aa  58.5  3e-08  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.69 
 
 
80 aa  58.5  3e-08  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.69 
 
 
80 aa  58.5  3e-08  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.69 
 
 
80 aa  58.5  3e-08  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  9.38667e-06 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.69 
 
 
80 aa  58.5  3e-08  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  57.69 
 
 
80 aa  58.5  3e-08  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.98 
 
 
93 aa  58.5  3e-08  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.61 
 
 
83 aa  58.2  4e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45 
 
 
94 aa  57.8  4e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1663  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.83 
 
 
101 aa  57.8  5e-08  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0733  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.27 
 
 
88 aa  57.8  6e-08  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0484  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.69 
 
 
80 aa  57.4  7e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0463  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.69 
 
 
80 aa  57.4  7e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0526  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.69 
 
 
80 aa  57.4  7e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0471  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.69 
 
 
80 aa  57.4  7e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0465  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.69 
 
 
80 aa  57.4  7e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2892  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  52.63 
 
 
82 aa  57  7e-08  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0846  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.33 
 
 
84 aa  57.4  7e-08  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136632  normal  0.343056 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3072  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.57 
 
 
84 aa  57  9e-08  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3110  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.57 
 
 
84 aa  57  9e-08  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.07 
 
 
83 aa  56.6  1e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0917  Exonuclease VII small subunit  56.6 
 
 
66 aa  56.6  1e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.074479 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0398  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.78 
 
 
80 aa  56.6  1e-07  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.37 
 
 
82 aa  55.8  2e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0634  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.03 
 
 
83 aa  55.8  2e-07  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.714213  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3174  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.37 
 
 
77 aa  55.8  2e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.1 
 
 
88 aa  56.2  2e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.1 
 
 
88 aa  56.2  2e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0399  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.86 
 
 
84 aa  55.5  3e-07  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171686  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3251  exodeoxyribonuclease VII small subunit  51.79 
 
 
84 aa  55.1  3e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0903  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
86 aa  55.5  3e-07  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0090  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.75 
 
 
80 aa  55.1  3e-07  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1171  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.83 
 
 
113 aa  54.7  4e-07  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.462861  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01898  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.09 
 
 
86 aa  55.1  4e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.90032  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.58 
 
 
86 aa  55.1  4e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3083  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50.88 
 
 
82 aa  54.7  4e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.07 
 
 
97 aa  54.7  5e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.820479 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.3 
 
 
85 aa  54.3  5e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50 
 
 
109 aa  54.3  5e-07  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155573  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0935  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.06 
 
 
80 aa  54.3  6e-07  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3296  exodeoxyribonuclease 7 small subunit  45.45 
 
 
80 aa  53.9  7e-07  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.83 
 
 
120 aa  53.9  7e-07  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3279  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.94 
 
 
82 aa  53.5  8e-07  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2872  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.39 
 
 
76 aa  53.5  8e-07  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0380914  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4199  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.39 
 
 
76 aa  53.5  9e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.55988e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4403  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.39 
 
 
76 aa  53.5  9e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0852123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4309  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.39 
 
 
76 aa  53.5  9e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000200233  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1032  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.94 
 
 
82 aa  53.5  9e-07  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4289  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.39 
 
 
76 aa  53.5  9e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.18628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3921  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.39 
 
 
76 aa  53.5  9e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3932  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.39 
 
 
76 aa  53.5  9e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2922  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.79 
 
 
81 aa  53.5  9e-07  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0945  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.39 
 
 
76 aa  53.5  9e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582074  hitchhiker  0.000128888 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.39 
 
 
76 aa  53.5  9e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1136  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.45 
 
 
79 aa  53.1  1e-06  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0495  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.45 
 
 
83 aa  53.1  1e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.45 
 
 
79 aa  53.1  1e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4252  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.34 
 
 
76 aa  53.1  1e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449361  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0414  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.83 
 
 
80 aa  53.1  1e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.04357  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.94 
 
 
76 aa  52.8  2e-06  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2790  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.64 
 
 
79 aa  52.4  2e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.282192  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.67 
 
 
82 aa  52.4  2e-06  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.67 
 
 
82 aa  52.4  2e-06  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4031  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.88 
 
 
76 aa  52.4  2e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0705396  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1664  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.57 
 
 
81 aa  52.4  2e-06  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.329844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.64 
 
 
76 aa  51.6  3e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00814066  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1776  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.1 
 
 
84 aa  51.6  3e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782365  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1614  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.64 
 
 
76 aa  51.6  3e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  6.44175e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1050  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.17 
 
 
70 aa  52  3e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2238  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50.94 
 
 
78 aa  51.6  4e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.264356 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1104  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.37 
 
 
85 aa  51.2  4e-06  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1199  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.83 
 
 
88 aa  51.2  5e-06  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2177  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.07 
 
 
76 aa  50.8  6e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  3.61923e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.64 
 
 
87 aa  50.8  6e-06  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2321  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.06 
 
 
77 aa  50.4  8e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1569  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.76 
 
 
88 aa  50.4  8e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0089  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.1 
 
 
76 aa  50.4  8e-06  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0300263  normal  0.239711 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4390  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.64 
 
 
89 aa  50.4  8e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.86848  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2633  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.46 
 
 
86 aa  50.4  9e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.665476  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3281  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.37 
 
 
77 aa  50.4  9e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1652  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.02 
 
 
88 aa  50.1  1e-05  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2893  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.98 
 
 
86 aa  49.7  1e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0998  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 
83 aa  49.7  1e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.11 
 
 
83 aa  49.7  1e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0569  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.11 
 
 
83 aa  49.7  1e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.72936  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1003  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.71 
 
 
86 aa  50.1  1e-05  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  8.98352e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>