85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0019 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 
441 aa  921  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  54.46 
 
 
435 aa  506  1e-142  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  55.67 
 
 
435 aa  486  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  46.35 
 
 
431 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  45.16 
 
 
452 aa  354  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  3.69598e-06 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  44.83 
 
 
429 aa  352  5e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  44.6 
 
 
429 aa  339  5e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  43.38 
 
 
440 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  44.39 
 
 
445 aa  328  1e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  42.06 
 
 
538 aa  276  8e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  38.93 
 
 
415 aa  269  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  33.55 
 
 
473 aa  263  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  36.02 
 
 
581 aa  245  1e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  36.25 
 
 
464 aa  242  9e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  33.26 
 
 
479 aa  241  3e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  35.53 
 
 
408 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  31.47 
 
 
446 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  34.62 
 
 
627 aa  222  9e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  6.01937e-05  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  32.46 
 
 
711 aa  222  1e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  32.57 
 
 
596 aa  216  9e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  34.79 
 
 
450 aa  209  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  36.31 
 
 
471 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  34.03 
 
 
473 aa  203  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  32.99 
 
 
479 aa  202  1e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  31.94 
 
 
479 aa  201  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  33.75 
 
 
340 aa  191  3e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  31.31 
 
 
494 aa  189  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  32.13 
 
 
447 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  3.1745e-08  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  30.31 
 
 
474 aa  179  7e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  32.61 
 
 
485 aa  179  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  32.55 
 
 
731 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  32.55 
 
 
644 aa  165  2e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  31.18 
 
 
478 aa  156  9e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  29.49 
 
 
463 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  29.58 
 
 
674 aa  149  1e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  30.15 
 
 
473 aa  148  2e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  29.6 
 
 
471 aa  147  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.6 
 
 
467 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  28.41 
 
 
478 aa  143  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  29.32 
 
 
482 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  5.03275e-08  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  29.78 
 
 
446 aa  140  4e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  31.34 
 
 
474 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  29.16 
 
 
446 aa  137  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  28.35 
 
 
500 aa  135  1e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  29.12 
 
 
505 aa  135  2e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  25.44 
 
 
464 aa  134  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  29.14 
 
 
532 aa  133  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  28.24 
 
 
492 aa  132  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  29.16 
 
 
495 aa  131  2e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  27.18 
 
 
490 aa  130  5e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  28.02 
 
 
466 aa  126  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  29.1 
 
 
410 aa  121  2e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  28.5 
 
 
663 aa  122  2e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  25.87 
 
 
534 aa  121  2e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  1.44391e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  27.07 
 
 
515 aa  117  4e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  32.61 
 
 
463 aa  114  4e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  26.08 
 
 
798 aa  112  1e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.27 
 
 
698 aa  111  2e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  23.91 
 
 
537 aa  110  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  1.99076e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  30.61 
 
 
690 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  26.82 
 
 
483 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2072  Alpha-L-fucosidase  26.22 
 
 
486 aa  103  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  29.19 
 
 
606 aa  100  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  39.69 
 
 
606 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  29.63 
 
 
638 aa  99.8  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  39.69 
 
 
584 aa  99.8  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  28.43 
 
 
434 aa  99.4  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.84 
 
 
709 aa  98.2  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  30.58 
 
 
212 aa  97.8  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  29.67 
 
 
704 aa  97.1  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.47 
 
 
687 aa  96.7  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  28.92 
 
 
932 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.89 
 
 
688 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  29.22 
 
 
750 aa  94.7  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.95 
 
 
487 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  29 
 
 
581 aa  94  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1541  Alpha-L-fucosidase  23.34 
 
 
516 aa  94  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  28.03 
 
 
470 aa  86.7  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  34.85 
 
 
484 aa  84  5e-15  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  26.69 
 
 
460 aa  83.2  7e-15  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  26.69 
 
 
460 aa  83.2  9e-15  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1302  glycoside hydrolase family alpha-L-fucosidase  25.52 
 
 
540 aa  78.2  3e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.186001 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.94 
 
 
704 aa  69.3  1e-10  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4241  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L- fucosidase)  28.47 
 
 
555 aa  61.6  2e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.525329  normal  0.717793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5083  hypothetical protein  28.31 
 
 
715 aa  52  2e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365257  normal  0.435002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>