More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0018 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
196 aa  402  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
198 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
198 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
198 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
199 aa  97.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  31.98 
 
 
211 aa  94  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 
211 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 
211 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 
198 aa  90.5  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 
212 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
214 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 
223 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 
213 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
187 aa  86.3  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 
221 aa  84.3  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
220 aa  81.6  6e-15  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 
194 aa  80.1  2e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  30.82 
 
 
198 aa  78.6  6e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
222 aa  76.3  3e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 
205 aa  74.7  8e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 
196 aa  73.9  1e-12  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  25.3 
 
 
195 aa  73.9  1e-12  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  25.3 
 
 
192 aa  73.9  1e-12  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  25.3 
 
 
196 aa  73.9  1e-12  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  25.3 
 
 
196 aa  73.9  1e-12  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  25.3 
 
 
196 aa  73.9  1e-12  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 
192 aa  73.9  1e-12  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  25.3 
 
 
196 aa  73.9  1e-12  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  25.3 
 
 
196 aa  73.9  1e-12  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  28.71 
 
 
202 aa  69.7  3e-11  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  60.78 
 
 
204 aa  68.9  5e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 
178 aa  67.8  9e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 
196 aa  66.6  2e-10  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 
214 aa  67  2e-10  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
198 aa  67  2e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 
201 aa  65.9  4e-10  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  54.9 
 
 
204 aa  64.7  8e-10  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 
199 aa  63.9  1e-09  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  55.56 
 
 
201 aa  64.3  1e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
209 aa  63.5  2e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
209 aa  63.5  2e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 
205 aa  62.8  3e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  30.16 
 
 
188 aa  62.8  3e-09  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  4.55593e-08 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  30.16 
 
 
188 aa  62.8  3e-09  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  3.3131e-09 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 
204 aa  62  5e-09  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
205 aa  61.6  7e-09  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
198 aa  61.6  8e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  32.18 
 
 
221 aa  61.2  8e-09  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 
199 aa  61.2  9e-09  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 
201 aa  60.1  2e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
206 aa  60.1  2e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
192 aa  60.5  2e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 
222 aa  60.1  2e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 
190 aa  59.7  3e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
187 aa  58.9  4e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 
241 aa  58.9  5e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
213 aa  58.5  6e-08  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
201 aa  58.5  6e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
213 aa  58.5  6e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
222 aa  58.5  6e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 
193 aa  57.8  9e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3393  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 
193 aa  57.4  1e-07  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
192 aa  57.8  1e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
192 aa  57.4  1e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
192 aa  57.4  1e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 
216 aa  56.6  2e-07  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0684  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
197 aa  56.6  2e-07  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.84339  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 
200 aa  57  2e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 
210 aa  56.2  3e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  27.45 
 
 
224 aa  55.8  4e-07  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  27.7 
 
 
219 aa  55.8  4e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
218 aa  55.8  4e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1503  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 
215 aa  55.8  4e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0825242 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2721  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
193 aa  55.8  4e-07  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.236108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
206 aa  55.5  5e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
187 aa  55.5  5e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0238  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 
191 aa  55.5  5e-07  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3670  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 
197 aa  55.5  5e-07  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411004  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 
195 aa  55.5  6e-07  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  41.89 
 
 
202 aa  55.1  6e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  29.71 
 
 
187 aa  55.1  7e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 
208 aa  54.7  8e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  32.84 
 
 
230 aa  54.7  8e-07  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 
242 aa  54.7  8e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 
198 aa  54.7  8e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 
205 aa  54.7  9e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 
206 aa  54.7  9e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 
230 aa  54.7  9e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  50.98 
 
 
199 aa  53.9  1e-06  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 
210 aa  53.9  1e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
244 aa  54.3  1e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 
203 aa  54.3  1e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
209 aa  53.9  1e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1229  regulatory protein, TetR  26.95 
 
 
235 aa  54.3  1e-06  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
195 aa  54.3  1e-06  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 
203 aa  54.3  1e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
211 aa  53.1  2e-06  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 
197 aa  53.9  2e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
212 aa  53.5  2e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>