More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0014 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0014  DNA primase  100 
 
 
645 aa  1326  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0081672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  48.71 
 
 
652 aa  611  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  49.46 
 
 
651 aa  608  1e-172  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  40.63 
 
 
655 aa  487  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  38.2 
 
 
623 aa  394  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  38.1 
 
 
588 aa  375  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  41.18 
 
 
590 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  38.18 
 
 
590 aa  375  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  40.87 
 
 
605 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  35.98 
 
 
598 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  35.4 
 
 
587 aa  310  4e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  34.91 
 
 
600 aa  310  6e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  31.81 
 
 
599 aa  310  7e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  34.18 
 
 
601 aa  305  2e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  32.46 
 
 
583 aa  304  4e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  38.66 
 
 
574 aa  303  6e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  32.11 
 
 
582 aa  299  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  31.41 
 
 
588 aa  299  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  37.55 
 
 
594 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  32.32 
 
 
587 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  37.45 
 
 
592 aa  294  4e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  35.58 
 
 
617 aa  293  5e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0527  DNA primase  37.5 
 
 
578 aa  293  8e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  38.35 
 
 
599 aa  293  9e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  36.5 
 
 
603 aa  290  7e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  34.56 
 
 
598 aa  290  8e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  34.27 
 
 
614 aa  289  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.25747e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  36.71 
 
 
605 aa  289  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  36.78 
 
 
599 aa  289  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  30.15 
 
 
595 aa  289  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  33.47 
 
 
604 aa  288  3e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  34.63 
 
 
600 aa  287  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  34.47 
 
 
604 aa  287  4e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  34.79 
 
 
598 aa  287  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  34.79 
 
 
598 aa  287  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  29.82 
 
 
595 aa  287  4e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  34.79 
 
 
598 aa  287  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  9.94887e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  34.79 
 
 
598 aa  287  5e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  34.79 
 
 
598 aa  287  5e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  34.79 
 
 
571 aa  286  7e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  2.15576e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  34.79 
 
 
598 aa  286  9e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.25124e-06  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  34.79 
 
 
598 aa  286  1e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  34.79 
 
 
598 aa  286  1e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  35.03 
 
 
614 aa  286  1e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  31.75 
 
 
595 aa  285  2e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  36.67 
 
 
603 aa  285  2e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  36.93 
 
 
656 aa  284  4e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  34.35 
 
 
588 aa  283  5e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  31.02 
 
 
613 aa  283  6e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  37.8 
 
 
655 aa  283  6e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  38.01 
 
 
631 aa  282  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  36.76 
 
 
639 aa  282  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  34.83 
 
 
676 aa  281  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  36.84 
 
 
651 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  39.87 
 
 
565 aa  282  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  36.49 
 
 
673 aa  281  2e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2205  DNA primase  34.69 
 
 
638 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  36.93 
 
 
663 aa  280  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  32.3 
 
 
577 aa  280  5e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  35.23 
 
 
609 aa  280  6e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.33993e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  31.12 
 
 
626 aa  280  6e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  36.26 
 
 
593 aa  280  7e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  34.58 
 
 
686 aa  280  8e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  36.16 
 
 
660 aa  280  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  37.35 
 
 
663 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  36.84 
 
 
652 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  36.16 
 
 
660 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  37.35 
 
 
660 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  35.65 
 
 
660 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  32.54 
 
 
588 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  32.12 
 
 
578 aa  278  3e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  37.12 
 
 
664 aa  277  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  34.91 
 
 
682 aa  277  5e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0887  DNA primase  36.99 
 
 
604 aa  277  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.612944  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  34.71 
 
 
675 aa  276  7e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  36.95 
 
 
638 aa  276  7e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0311  DNA primase  34.84 
 
 
583 aa  276  8e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157771  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  35.57 
 
 
573 aa  276  1e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3642  DNA primase  33.87 
 
 
625 aa  275  1e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  32.87 
 
 
584 aa  276  1e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  32.66 
 
 
576 aa  276  1e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  9.4448e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3885  DNA primase  33.87 
 
 
625 aa  275  1e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.987209  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4481  DNA primase  33.87 
 
 
800 aa  275  2e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  32.87 
 
 
584 aa  275  2e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  34.39 
 
 
586 aa  275  2e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  33.79 
 
 
585 aa  275  2e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  35.54 
 
 
660 aa  274  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  36.16 
 
 
646 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3256  DNA primase  33.27 
 
 
622 aa  275  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0530643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  36.16 
 
 
646 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2821  DNA primase  36.56 
 
 
622 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  38.03 
 
 
619 aa  274  4e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  32.76 
 
 
573 aa  273  5e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  35.1 
 
 
601 aa  273  6e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  34.54 
 
 
564 aa  273  6e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3782  DNA primase  33.1 
 
 
622 aa  273  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18227  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2607  DNA primase  36.81 
 
 
613 aa  273  8e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.496345  normal  0.674189 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2216  DNA primase  36.02 
 
 
603 aa  272  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  30.5 
 
 
596 aa  272  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4814  DNA primase  37.17 
 
 
636 aa  272  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>