More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0012 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  100 
 
 
620 aa  1265  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  48.12 
 
 
618 aa  544  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  47.32 
 
 
629 aa  529  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  46.26 
 
 
891 aa  226  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2358  hypothetical protein  43.64 
 
 
769 aa  213  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.916043  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0935  peptidase domain-containing protein  42.07 
 
 
758 aa  209  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3752  hypothetical protein  44.85 
 
 
773 aa  206  9e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000190776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3121  hypothetical protein  41.45 
 
 
792 aa  202  1e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3007  hypothetical protein  43.17 
 
 
576 aa  196  8e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1576  peptidase domain-containing protein  39.38 
 
 
760 aa  191  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.599229  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  42.34 
 
 
717 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  8.36331e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  37.8 
 
 
709 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  40.4 
 
 
710 aa  174  4e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3724  hypothetical protein  38.25 
 
 
289 aa  167  6e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3913  hypothetical protein  36.27 
 
 
289 aa  167  7e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  35.69 
 
 
510 aa  137  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  31.38 
 
 
298 aa  113  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.4 
 
 
292 aa  99.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  33.16 
 
 
572 aa  97.8  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  9.00599e-07 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.84 
 
 
407 aa  97.1  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 
429 aa  96.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.0948e-15  normal 
 
 
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.83 
 
 
407 aa  95.9  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  2.66488e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  31.67 
 
 
354 aa  93.6  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  31.28 
 
 
435 aa  92.8  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  4.01957e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.85 
 
 
362 aa  90.5  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  31.82 
 
 
427 aa  90.5  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.81605e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  29 
 
 
419 aa  90.1  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  30.36 
 
 
316 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  34.05 
 
 
615 aa  89  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  29.74 
 
 
567 aa  88.2  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  1.19274e-05 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  30.54 
 
 
432 aa  88.2  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  29.03 
 
 
441 aa  87.8  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.49 
 
 
430 aa  87  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  29.24 
 
 
717 aa  86.7  1e-15  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  31.05 
 
 
461 aa  85.5  3e-15  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  28 
 
 
416 aa  84.7  4e-15  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  31.94 
 
 
439 aa  84.3  6e-15  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.38 
 
 
446 aa  84  8e-15  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  29.47 
 
 
445 aa  83.2  1e-14  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  31.58 
 
 
454 aa  83.6  1e-14  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  29.15 
 
 
442 aa  82.4  2e-14  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  29.06 
 
 
439 aa  82.8  2e-14  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.95 
 
 
442 aa  82.4  2e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  32.66 
 
 
449 aa  82.8  2e-14  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  29.63 
 
 
440 aa  82.4  2e-14  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  43.88 
 
 
437 aa  82  3e-14  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  30.85 
 
 
440 aa  82  3e-14  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  4.1437e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  27.22 
 
 
436 aa  81.6  4e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.26 
 
 
446 aa  81.6  4e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  30.57 
 
 
445 aa  81.6  4e-14  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.26 
 
 
446 aa  81.6  4e-14  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.41 
 
 
442 aa  80.9  6e-14  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  29.1 
 
 
443 aa  80.5  8e-14  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.19 
 
 
446 aa  80.5  9e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  28.65 
 
 
461 aa  80.1  1e-13  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.33 
 
 
444 aa  79.7  1e-13  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  2.57607e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  29.69 
 
 
444 aa  78.6  3e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  31.67 
 
 
450 aa  78.6  3e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  28.65 
 
 
443 aa  78.6  3e-13  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  29.23 
 
 
444 aa  78.2  4e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  29.23 
 
 
444 aa  78.2  4e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  28.65 
 
 
446 aa  78.2  5e-13  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  29.23 
 
 
469 aa  77.8  5e-13  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  2.01302e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  28.65 
 
 
443 aa  77.8  6e-13  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.11 
 
 
450 aa  77.8  6e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1458  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.5 
 
 
367 aa  77.4  7e-13  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0940503  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  28.11 
 
 
443 aa  77  9e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.34 
 
 
445 aa  76.6  1e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  28.89 
 
 
434 aa  76.6  1e-12  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  28.65 
 
 
450 aa  76.6  1e-12  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3729  WD40 domain protein beta Propeller  44.83 
 
 
354 aa  77  1e-12  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.135548  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2397  WD40 domain-containing protein  43.75 
 
 
352 aa  76.3  2e-12  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.84296e-06 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  29.79 
 
 
462 aa  76.3  2e-12  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  29.48 
 
 
434 aa  75.9  2e-12  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  31.76 
 
 
444 aa  76.3  2e-12  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  7.50977e-07  decreased coverage  9.15698e-05 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  28.42 
 
 
451 aa  75.9  2e-12  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  29.45 
 
 
443 aa  75.5  3e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  27.78 
 
 
432 aa  74.7  5e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  26.27 
 
 
457 aa  74.7  5e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  30 
 
 
441 aa  74.3  6e-12  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  27.86 
 
 
646 aa  74.3  6e-12  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  32.28 
 
 
441 aa  73.9  8e-12  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  2.57042e-08  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  27.64 
 
 
436 aa  73.2  1e-11  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  30.9 
 
 
434 aa  73.6  1e-11  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  27.98 
 
 
430 aa  72.8  2e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  29.83 
 
 
446 aa  72.8  2e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  27.98 
 
 
430 aa  72.4  2e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  30.98 
 
 
435 aa  72.8  2e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  30.98 
 
 
435 aa  72.8  2e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  26.84 
 
 
435 aa  72.4  2e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  36.26 
 
 
450 aa  72.4  3e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  24.5 
 
 
1005 aa  72  3e-11  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  28.66 
 
 
424 aa  72  3e-11  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  25.45 
 
 
434 aa  72.4  3e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  30.37 
 
 
437 aa  72  3e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28 
 
 
395 aa  71.6  4e-11  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  28.18 
 
 
434 aa  71.6  4e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  29.93 
 
 
444 aa  71.6  4e-11  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  28.92 
 
 
435 aa  71.6  4e-11  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  27.37 
 
 
442 aa  71.2  5e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  9.78843e-07  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>