32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0005 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0005  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
482 aa  964  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153981  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0534  TPR repeat-containing protein  61.11 
 
 
437 aa  112  1e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0657  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 
435 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1614  TPR repeat-containing protein  43.24 
 
 
389 aa  70.1  7e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1257  TPR repeat-containing protein  36.57 
 
 
464 aa  68.9  2e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  38.2 
 
 
593 aa  65.9  2e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1951  TPR repeat-containing protein  46.48 
 
 
476 aa  63.5  7e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4623  hypothetical protein  39.74 
 
 
336 aa  63.5  7e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4409  TPR repeat-containing protein  39.74 
 
 
620 aa  63.5  8e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0690  hypothetical protein  39.53 
 
 
241 aa  61.2  4e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0181  hypothetical protein  41.67 
 
 
299 aa  60.8  6e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 
615 aa  60.5  7e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2627  hypothetical protein  29.2 
 
 
319 aa  58.5  2e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000512231  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3831  TPR repeat-containing protein  43.66 
 
 
464 aa  58.2  3e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.948329 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1639  hypothetical protein  37.63 
 
 
178 aa  57  7e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0764738  hitchhiker  0.00145083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0044  hypothetical protein  35.79 
 
 
377 aa  55.5  2e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.314723 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2840  hypothetical protein  43.24 
 
 
87 aa  53.1  1e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2964  hypothetical protein  37.33 
 
 
171 aa  52  2e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  1.29712e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4082  TPR repeat-containing protein  36.62 
 
 
492 aa  52  2e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1314  hypothetical protein  35.56 
 
 
185 aa  52  2e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1393  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
351 aa  52  3e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1125  hypothetical protein  32.65 
 
 
160 aa  50.1  8e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1166  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
334 aa  50.1  8e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0738188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0658  hypothetical protein  41.27 
 
 
438 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0533  hypothetical protein  38.1 
 
 
421 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0306  hypothetical protein  38.24 
 
 
377 aa  46.6  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279788  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2624  hypothetical protein  30.67 
 
 
379 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  1.77581e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0752  TPR repeat-containing protein  42.25 
 
 
634 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100728  normal  0.0772992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0004  hypothetical protein  39.39 
 
 
287 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.971077  hitchhiker  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0235  hypothetical protein  38.36 
 
 
378 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0182  hypothetical protein  33.8 
 
 
226 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1509  tetratricopeptide TPR_2  39.71 
 
 
341 aa  43.5  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>