147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0002 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0002  hypothetical protein  100 
 
 
622 aa  1238  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.85538e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4183  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  49.69 
 
 
647 aa  562  1e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0561  amino acid permease-associated region  41.95 
 
 
614 aa  443  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3857  amino acid permease-associated region  41.57 
 
 
614 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  4.27762e-06  unclonable  1.51298e-05 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  40.29 
 
 
615 aa  428  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  40.62 
 
 
627 aa  407  1e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.00657e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  37.94 
 
 
693 aa  405  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4342  amino acid permease-associated region  40.16 
 
 
611 aa  390  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676732  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  39.33 
 
 
672 aa  391  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  38.36 
 
 
612 aa  389  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  37.44 
 
 
629 aa  376  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  38.18 
 
 
629 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  36.32 
 
 
608 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  36.48 
 
 
608 aa  368  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  8.52812e-08  decreased coverage  4.41814e-23 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  36.96 
 
 
608 aa  362  8e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  35.97 
 
 
611 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  36.8 
 
 
608 aa  349  7e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  36.48 
 
 
608 aa  349  9e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.00582e-24 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3408  amino acid permease-associated region  37.39 
 
 
750 aa  346  9e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492526  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  34.93 
 
 
609 aa  345  1e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  3.41492e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  34.93 
 
 
609 aa  345  1e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  35.29 
 
 
608 aa  345  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  36.48 
 
 
608 aa  345  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  3.55688e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  36.48 
 
 
608 aa  345  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  34.97 
 
 
653 aa  344  3e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  35.84 
 
 
608 aa  342  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.21839e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  35.5 
 
 
627 aa  342  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  4.94308e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  35.48 
 
 
585 aa  339  8e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  34.73 
 
 
609 aa  338  2e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  34.13 
 
 
636 aa  337  3e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  35.34 
 
 
781 aa  334  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1503  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  38.22 
 
 
619 aa  333  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  35.54 
 
 
683 aa  332  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  35.02 
 
 
681 aa  331  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  34.41 
 
 
677 aa  330  4e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  34.73 
 
 
664 aa  326  8e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  34.73 
 
 
664 aa  326  8e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  34.98 
 
 
614 aa  325  2e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  34.67 
 
 
664 aa  324  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6758  hypothetical protein  35.58 
 
 
704 aa  322  1e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  35.91 
 
 
682 aa  322  1e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  3.28435e-05  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  35.61 
 
 
658 aa  321  3e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3335e-07 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  36.93 
 
 
615 aa  321  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  35.41 
 
 
685 aa  321  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  36.51 
 
 
668 aa  319  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  34.67 
 
 
672 aa  318  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  33.94 
 
 
672 aa  317  5e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1487  hypothetical protein  34.62 
 
 
696 aa  317  6e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479036  normal  0.671369 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  35.69 
 
 
674 aa  316  9e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  33.99 
 
 
654 aa  315  1e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  34.16 
 
 
674 aa  312  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  33.17 
 
 
615 aa  311  2e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  32.97 
 
 
664 aa  310  6e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1452  hypothetical protein  34.93 
 
 
691 aa  309  1e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000394394  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  35.16 
 
 
731 aa  308  2e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  33.49 
 
 
655 aa  307  4e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  34.62 
 
 
612 aa  303  5e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  7.70343e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  36.89 
 
 
777 aa  302  1e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1709  hypothetical protein  34.86 
 
 
667 aa  301  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.71467  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3926  amino acid permease-associated region  33.49 
 
 
664 aa  301  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036267  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  33.74 
 
 
678 aa  300  7e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  35.26 
 
 
614 aa  300  7e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  34.21 
 
 
657 aa  299  9e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1916  hypothetical protein  34.76 
 
 
667 aa  292  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635201  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1943  putative transporter  34.82 
 
 
678 aa  290  4e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630635  normal  0.0235121 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1563  putative transporter  34.55 
 
 
677 aa  280  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.694586 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  33 
 
 
774 aa  275  2e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1443  amino acid permease-associated region  42.51 
 
 
470 aa  272  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  41.64 
 
 
365 aa  237  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  29.24 
 
 
815 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  30.89 
 
 
657 aa  181  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0942  amino acid transporter-like protein  27.51 
 
 
680 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.589203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  28.2 
 
 
680 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3101  amino acid transporter-like protein  27.08 
 
 
685 aa  176  1e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2571  amino acid transporter-like  29.74 
 
 
656 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  30.4 
 
 
713 aa  168  3e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  30.4 
 
 
713 aa  168  3e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  31.25 
 
 
657 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0024  lysine-specific permease  28.57 
 
 
647 aa  150  6e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1995  hypothetical protein  28.57 
 
 
647 aa  150  6e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1725  amino acid permease, central region  40.93 
 
 
253 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759722  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13060  amino acid transporter  27.2 
 
 
650 aa  131  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1726  amino acid permease, C-terminal  30.74 
 
 
272 aa  124  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0922786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1041  amino acid permease-associated region  32.64 
 
 
657 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1038  amino acid permease-associated region  32.64 
 
 
657 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0979  amino acid permease-associated region  30.26 
 
 
655 aa  90.5  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.696975  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1748  hypothetical protein  23.91 
 
 
218 aa  76.6  1e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0151353  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  24.21 
 
 
440 aa  65.1  4e-09  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1724  amino acid permease, N-terminal  38.2 
 
 
101 aa  60.8  7e-08  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  26.85 
 
 
440 aa  60.1  1e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  26.35 
 
 
440 aa  57  1e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  23.32 
 
 
443 aa  56.6  1e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  22.34 
 
 
443 aa  56.6  1e-06  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  23.32 
 
 
443 aa  56.6  1e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  23.7 
 
 
441 aa  56.6  1e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 
449 aa  55.8  2e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  22.34 
 
 
443 aa  55.8  2e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  22.34 
 
 
443 aa  55.8  3e-06  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  23.51 
 
 
443 aa  55.5  3e-06  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  23.32 
 
 
443 aa  55.1  4e-06  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>