More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_R0008 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_R0008  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0027  tRNA-Met  95.65 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0920329  hitchhiker  0.000285559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  95.65 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0011  tRNA-Met  98.31 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089204  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0068  tRNA-Met  94.2 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0080  tRNA-Met  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00406069  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0017  tRNA-Met  95.24 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t71  tRNA-Met  96.55 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0872657  hitchhiker  0.00727048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t022  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0077  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna065  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000522671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0019  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0094  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2751  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.74519e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0005  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.098649 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0020  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna063  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000457869  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna116  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000457869  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03399  tRNA-Met  96.55 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna067  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000491703  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00108  tRNA-Met  96.55 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0096  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0171  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761498  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2750  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.88112e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2747  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000177551  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet01  tRNA-Met  96.55 
 
 		 80 bp  99.6  9e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0040  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251493  hitchhiker  0.0001025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0041  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000296842  normal  0.054295 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3184  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0039  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00627079  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00104  tRNA-Met  96.55 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna069  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000397196  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna073  tRNA-Met  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000472118  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3197t  tRNA-Met  96.49 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3199t  tRNA-Met  96.49 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.976924  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0020  tRNA-Met  92.75 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3203t  tRNA-Met  96.49 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0036  tRNA-Met  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-3  tRNA-Met  96.49 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-4  tRNA-Met  96.49 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.567742  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-5  tRNA-Met  96.49 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0035  tRNA-Met  92.75 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.84698e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0012  tRNA-Met  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  92.75 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0013  tRNA-Met  92.75 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.0245771 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0055  tRNA-Met  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0025  tRNA-Met  94.2 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0010  tRNA-Met  92.75 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563126  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  92.75 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0084  tRNA-Met  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0249486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0022  tRNA-Met  92.75 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000159989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0073  tRNA-Met  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000821998  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0020  tRNA-Met  92.75 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0035  tRNA-Met  96.49 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0088  tRNA-Met  96.49 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3201t  tRNA-Met  96.49 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3204t  tRNA-Met  96.49 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0052  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.902877 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0053  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.896198 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0054  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.871356 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0055  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.867908 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0056  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.880459 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0057  tRNA-Met  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.88568 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0043  tRNA-Met  92.75 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.399945  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0069  tRNA-Met  92.75 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t058  tRNA-Met  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0442009  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0063  tRNA-Met  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00364456  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2749  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000330212  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00100  tRNA-Met  96.43 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0078  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0079  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0078  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0634809  normal  0.33041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0079  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.060888  normal  0.335766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0060  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00315069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0041  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0831228  normal  0.361197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0074  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.291778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0075  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0076  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.195191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5667  tRNA-Met  94.92 
 
 		 79 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000879492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0282  tRNA-Met  94.92 
 
 		 79 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5710  tRNA-Met  94.92 
 
 		 79 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5699  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000350684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-4  tRNA-Met  94.92 
 
 		 80 bp  93.7  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-6  tRNA-Met  94.92 
 
 		 80 bp  93.7  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00001255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-2  tRNA-Met  94.92 
 
 		 80 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0383767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-3  tRNA-Met  94.92 
 
 		 80 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000267735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  94.92 
 
 		 80 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-8  tRNA-Met  94.92 
 
 		 80 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4773  tRNA-Met  94.92 
 
 		 79 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000665438  hitchhiker  6.54659e-16 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0604  tRNA-Met  94.92 
 
 		 79 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000969852  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0046  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.918384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5678  tRNA-Met  94.92 
 
 		 79 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5737  tRNA-Met  94.92 
 
 		 79 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0082  tRNA-Met  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0306  tRNA-Met  94.92 
 
 		 79 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>