264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1588 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1588  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  100 
 
 
282 aa  584  1e-166  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1052  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.09 
 
 
297 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1062  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  65.6 
 
 
301 aa  402  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0578  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.31 
 
 
292 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0290  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.96 
 
 
291 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.213376 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2942  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.31 
 
 
291 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000870309  hitchhiker  0.000753437 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3673  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  66.31 
 
 
291 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113382  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1265  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.6 
 
 
289 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.127189  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2034  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.25 
 
 
294 aa  395  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000016391  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0641  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.96 
 
 
291 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.963303  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1687  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.25 
 
 
290 aa  396  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0323438 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0655  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.6 
 
 
292 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79988e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0598  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.54 
 
 
290 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.4959400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1711  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.89 
 
 
300 aa  391  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.271634  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2473  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.18 
 
 
295 aa  390  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000559349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2446  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.89 
 
 
290 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1023  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.89 
 
 
291 aa  391  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.165229  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.96 
 
 
292 aa  393  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3048  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.48 
 
 
296 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0314071  normal  0.0184819 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0732  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.14 
 
 
286 aa  389  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0992  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.48 
 
 
289 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0603  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.83 
 
 
319 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0484  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.48 
 
 
295 aa  385  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.411276  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16221  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.12 
 
 
290 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0239928  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3696  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.48 
 
 
325 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0915  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.77 
 
 
292 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0708  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.44 
 
 
286 aa  384  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4255  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.48 
 
 
296 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00424245  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3659  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.57 
 
 
298 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0870  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.11 
 
 
308 aa  381  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3534  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.86 
 
 
327 aa  381  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0200192 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0778  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.77 
 
 
290 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2457  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.77 
 
 
292 aa  382  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000472181  hitchhiker  0.000000000290022 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0551  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.57 
 
 
301 aa  381  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1207  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.48 
 
 
294 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0202592  normal  0.156512 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1305  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.83 
 
 
309 aa  381  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1734  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.12 
 
 
291 aa  381  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.424728  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0788  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  62.41 
 
 
290 aa  382  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0493212  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1440  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.5 
 
 
321 aa  381  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12601  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.77 
 
 
293 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.879707  hitchhiker  0.00432496 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2348  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.21 
 
 
312 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3381  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.41 
 
 
318 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.899304 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13351  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.06 
 
 
289 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1288  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.12 
 
 
312 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2651  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.83 
 
 
309 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3866  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.77 
 
 
294 aa  379  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.086859  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2555  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.83 
 
 
309 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00956697  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0443  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.12 
 
 
308 aa  378  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0692449  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4744  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.41 
 
 
301 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1092  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  63.12 
 
 
293 aa  377  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1220  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.62 
 
 
304 aa  375  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.28 
 
 
296 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2460  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.77 
 
 
326 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.581203  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4203  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.12 
 
 
301 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1863  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.06 
 
 
294 aa  374  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1516  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.7 
 
 
303 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.603304  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2690  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.14 
 
 
290 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3426  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.14 
 
 
290 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0543  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.32 
 
 
317 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4336  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.64 
 
 
294 aa  371  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0216  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.35 
 
 
317 aa  371  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0389393 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3936  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  61.7 
 
 
289 aa  374  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.429438  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4178  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.7 
 
 
314 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0527  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.32 
 
 
317 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0240153 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0882  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.18 
 
 
390 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.295229  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1561  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.28 
 
 
290 aa  368  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.442148  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0812  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.64 
 
 
296 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.211227  hitchhiker  0.00219501 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2351  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.18 
 
 
392 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0645  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.46 
 
 
312 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0633  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.01 
 
 
283 aa  369  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0792237  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00110  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.86 
 
 
318 aa  367  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.62 
 
 
317 aa  368  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.569318 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0406  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.86 
 
 
335 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.995928  normal  0.36561 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1320  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.83 
 
 
299 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.797629  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1053  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.14 
 
 
289 aa  365  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0252049  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2162  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60 
 
 
328 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676955  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3256  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.79 
 
 
306 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0922  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.93 
 
 
292 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000402813  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.86 
 
 
315 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0219  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.18 
 
 
335 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0687  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.84 
 
 
335 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0398662  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0717  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.18 
 
 
335 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0372  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.86 
 
 
314 aa  365  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2431  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.18 
 
 
335 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213076  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1002  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.92 
 
 
286 aa  367  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.607985  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0598  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.86 
 
 
334 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0585  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.84 
 
 
390 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.56 
 
 
287 aa  365  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0153019  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13561  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.13 
 
 
268 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.338754  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12450  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.32 
 
 
282 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.84 
 
 
335 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0984004  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13651  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.13 
 
 
268 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.229398  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1091  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.5 
 
 
287 aa  367  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1567  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.64 
 
 
296 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.344409  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.86 
 
 
315 aa  364  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1196  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.7 
 
 
317 aa  365  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0503079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.21 
 
 
315 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0702  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.18 
 
 
335 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3371  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  60.28 
 
 
333 aa  366  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00416718  normal  0.205184 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2727  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.18 
 
 
335 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>