More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1527 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  100 
 
 		 482 aa  981    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  47.52 
 
 		 521 aa  432  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  55.18 
 
 		 871 aa  429  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  46.06 
 
 		 514 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  55.04 
 
 		 520 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  46.79 
 
 		 520 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  55.04 
 
 		 520 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  45.55 
 
 		 520 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  45.68 
 
 		 502 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  49.18 
 
 		 787 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  51.03 
 
 		 520 aa  413  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  46.89 
 
 		 502 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  45.05 
 
 		 558 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  47.58 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  44.95 
 
 		 599 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  49.87 
 
 		 503 aa  409  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  46.74 
 
 		 523 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  47.36 
 
 		 494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  46.62 
 
 		 498 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  45.15 
 
 		 599 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  51.57 
 
 		 503 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  44.95 
 
 		 599 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  43.58 
 
 		 603 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  46.85 
 
 		 520 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  46.77 
 
 		 497 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  46.77 
 
 		 497 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  50.38 
 
 		 570 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  44.49 
 
 		 523 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  45.96 
 
 		 524 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  46.77 
 
 		 497 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  41.78 
 
 		 573 aa  405  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  49.23 
 
 		 518 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  47.44 
 
 		 511 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  46.98 
 
 		 521 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  46.98 
 
 		 521 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  49.1 
 
 		 500 aa  404  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  46.95 
 
 		 507 aa  402  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  47.21 
 
 		 521 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  46.54 
 
 		 497 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  44.47 
 
 		 553 aa  400  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  49.74 
 
 		 486 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  45.09 
 
 		 553 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  46.05 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  49.1 
 
 		 501 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  48.22 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  47.13 
 
 		 514 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  47.85 
 
 		 523 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  47.96 
 
 		 493 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  50 
 
 		 561 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  48.09 
 
 		 521 aa  398  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  46.28 
 
 		 521 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  49.75 
 
 		 495 aa  398  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  46.28 
 
 		 521 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  47.96 
 
 		 493 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  46.46 
 
 		 489 aa  396  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  43.72 
 
 		 494 aa  398  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  46.28 
 
 		 521 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  47.96 
 
 		 493 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  43.43 
 
 		 610 aa  395  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  46.28 
 
 		 521 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  47.8 
 
 		 564 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  47.96 
 
 		 493 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  43.01 
 
 		 553 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  47.96 
 
 		 493 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  50.13 
 
 		 498 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  42.41 
 
 		 561 aa  395  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0251  type II secretion system protein E  47.11 
 
 		 484 aa  393  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  47.13 
 
 		 521 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  51.44 
 
 		 514 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  46.7 
 
 		 559 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  43.86 
 
 		 555 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  46.08 
 
 		 497 aa  393  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  49.1 
 
 		 499 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  49.48 
 
 		 563 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  48.05 
 
 		 585 aa  391  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  49.48 
 
 		 573 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  41.06 
 
 		 577 aa  392  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  47.69 
 
 		 515 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  47.07 
 
 		 487 aa  390  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  42.07 
 
 		 568 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2652  type II secretion system protein E  48.69 
 
 		 505 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0316  type II secretion system protein E  49.87 
 
 		 497 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.218046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0232  general secretory pathway protein E  48.73 
 
 		 525 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  48.84 
 
 		 561 aa  391  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  49.1 
 
 		 490 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  40.91 
 
 		 567 aa  391  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  47.69 
 
 		 497 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  47.69 
 
 		 497 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  47.69 
 
 		 497 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  47.69 
 
 		 497 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  42.65 
 
 		 580 aa  388  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  42.26 
 
 		 477 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1387  type II secretion system protein E  43.78 
 
 		 577 aa  388  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00517077  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  40.89 
 
 		 568 aa  387  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  47.91 
 
 		 471 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  47.69 
 
 		 497 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  47.69 
 
 		 572 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  47.69 
 
 		 497 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  46.68 
 
 		 569 aa  388  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  47.69 
 
 		 497 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>